“十二五”期間，亳州藥業產業的規模化、集約化、國際化水平明顯提高，創新能力不斷增強，產業鏈更加完備，中藥工業總產值將達到100億元以上，亳州將建設成為全國聞名的現代中藥高技術產業化基地。
特別是“中華藥都·養生亳州”行動計劃實施以來，全市上下認真貫徹落實科學發展觀，堅持以藥立市，大力發展中藥工業，加強政策扶持，不斷延伸產業鏈條，中藥產業發展迅速，逐步形成中成藥、中藥飲片、中藥保健酒、中藥保健食品等七大主導產品，全市藥業經濟呈現出蓬勃發展的良好勢頭。截止2009年底，亳州***有藥業生產企業54家，藥業農業產業化市級以上龍頭企業29家，其中國家級2家，省級11家，中藥材年交易額200億元左右。2009年，全市藥業企業實現銷售收入50億元，同比增長42.8%；實現利稅18605萬元，同比增長32.9%；工業增加值81466萬元，同比增長38.6%；我市中藥進出口6279萬美元，同比增長37.2%。2009年亳州市對韓出口2308萬美元，占我國對韓出口總量的43%，成為我國對韓最大的中藥材及飲片出口基地。我市已發展成為全國中藥材貿易中心和區域性中藥材加工制造中心。
為進壹步發展中藥材交易中心的龍頭作用，增強交易中心的輻射力，占地180畝的交易中心二期工程已經全面啟動，項目包括鋪面房、大型倉儲、大型停車場、學校、醫院和中華藥都大酒店。中華藥都投資股份公司計劃用壹年的時間完成二期工程的開發、建設、從而使交易中心形成交易規管理科學、配套完善、環境優美、特色鮮明的全國乃至全世界最大的中藥材集散地。