1·數據的收集和錄入。物流數據的收集首先是將數據通過收集子系統從系統內部或者外部收集到預處理系統中，並整理成為系統要求的格式和形式，然後再通過輸入子系統輸入到物流信息系統中。這壹基本功能是其他功能發揮作用的前提和基礎。
2·信息的存儲。物流數據進入到系統中之後，經過整理和加工，成為支持物流系統運行的物流信息，這些信息需要暫時存儲和永久保存以供使用。物流信息系統的存儲功能就是保證已得到的後勤信息能夠不丟失、不走樣、不外泄、整理得當、隨時可用。無論哪壹種物流信息系統，聲涉及信息的存儲問題時，都要考慮存儲量、信息格式、存儲方式、使用方式、存儲時間、安全保密等問題。數據的存儲必須要考慮數據的組織，目的是為了數據的處理和檢索。
3·信息的傳輸。物流數據和信息在物流系統中，必須及時、準確傳輸到各個職能環節，龍能發揮其功效，這就需要物流信息系統具有克服空間障礙的功能。物流信息系統必須要充分考慮所要傳遞的信息種類、數量、頻率、可靠性要求等因素。
4·信息的處理。物流信息系統的最基本目標，就是將輸入數據加工處理成物流信息。信息處理可以是簡單的查詢、排序，也可以是復雜的模型求解和預測，信息處理能力是衡量物流信息系統能力的壹個極其重要的方面。所謂物流數據是指不能直接滿足物流作業系統某壹環節的需要，但又與之密切相關，只要通過壹系列的信息處理就可以滿足需要的物流情報。而那些能夠直接或者經過信息處理後能夠在某壹作業環節上發揮功能的物流情報，就稱為物流信息。
5．信息的輸出。物流信息系統的目的是為各級物流人員提供信息。為了便於人員理解，系統輸出的形式應力求易讀易懂、直觀醒目，這是評價物流信息系統的主要標準之壹。