投資管理制度
壹是制定和完善負面清單。在2013版負面清單的基礎上，今年6月修訂出臺2014版負面清單，將外商投資準入特別管理措施由190條減少到139條，調整率達26.8%，進壹步提高了開放度和透明度，進壹步銜接了國際通行規則，為中美BIT談判提供參考，得到國內外各方的積極評價。
二是實施外商投資備案管理和境外投資備案管理制度。負面清單以外領域的外商投資項目核準制和企業合同章程審批制全部改為備案制。同時，建立以備案制為主的境外投資管理方式，試驗區管委會可在5個工作日內辦結備案手續。
三是深化商事登記制度改革。工商部門實施註冊資本認繳制等改革，區內新設公司註冊資本的申報出資、認繳年限等未出現異常情況。實施了企業準入“單壹窗口”制度，企業準入由“多個部門多頭受理”改為“壹個部門、壹個窗口集中受理”。質監部門推出了組織機構代碼實時賦碼。稅務部門推出10項“辦稅壹網通”創新措施，實現稅務登記號碼網上自動賦碼。
四是落實服務業擴大開放措施。總體方案確定的服務業23項開放措施全面實施，並且建立了相應的監管制度和監管措施，目前已有283個項目落地。今年國務院又批準了新壹輪31項擴大開放措施。
監管制度創新
壹是創新“壹線放開、二線安全高效管住、區內自由”監管制度。海關推出“先進區、後報關”、“批次進出、集中申報”等23項監管服務創新舉措。檢驗檢疫推出“通關無紙化”、“第三方檢驗結果采信”等23項改革措施。海事推出了船舶安全作業監管、高效率船舶登記流程等15項新制度。同時，海關、檢驗檢疫聯動實施“壹次申報、壹次查驗、壹次放行”監管試點，並在壹線出境、二線入區環節實現通關單無紙化。
二是啟動實施國際貿易“單壹窗口”管理制度。借鑒國際通行規則，建立貿易、運輸、加工、倉儲等業務的跨部門綜合管理服務平臺。今年先建設口岸監管“單壹窗口”，6月18日已實現部分功能上線運行。
三是探索建立貨物狀態分類監管制度。對保稅貨物、非保稅貨物、口岸貨物進行分類監管，提高通關速度，控制監管風險。目前，海關已制定監管方案和操作規範，確定試點企業。
金融制度創新
在堅持宏觀審慎、風險可控的前提下，人民銀行、銀監會、證監會、保監會推出了51條創新舉措，在自由貿易賬戶體系、投融資匯兌便利、人民幣跨境使用、利率市場化、外匯管理改革5個方面形成了“壹線放開、二線嚴格管理的宏觀審慎”的金融制度框架和監管模式，為國家金融改革做好“壓力測試”。
壹是金融創新措施不斷推出。“壹行三會”積極推動資本項目可兌換、人民幣跨境使用、利率市場化和外匯管理改革等方面的先行先試。人民銀行出臺了分賬核算、外匯管理等7個細則文件。銀監會出臺了簡化準入、風險評估等4個實施細則。證監會、保監會也出臺了相關操作辦法，進壹步推進了金融服務業的開放。
二是金融服務功能不斷增強。87家有金融牌照的機構和壹批金融服務企業已入駐區內，啟動實施了壹批服務實體經濟和投資貿易便利化的金融創新業務。同時，面向國際的金融市場平臺建設正在有序推進，上海國際能源交易中心、國際黃金交易中心已批準成立。
三是建立完善金融監管和防範風險的機制。“壹行三會”駐滬機構和上海市政府建立監管協調機制和跨境資金流動監測機制，人行上海總部和試驗區管委會建立“反洗錢、反恐融資、反逃稅”監管機制。同時，進壹步完善金融宏觀審慎管理措施和切實加強機構風險管理自我責任。
政府管理創新
加快轉變政府職能，由註重事前審批轉為註重事中事後監管，形成6項制度為主體的事中事後監管制度框架，加強對市場主體“寬進”以後的過程監督和後續管理。
壹是建立安全審查制度。重點是建立在外資企業準入階段協助國家有關部門進行安全審查的工作機制。目前已經制定形成試驗區安全審查辦法。
二是建立反壟斷審查制度。重點是探索在經營者集中、壟斷協議和濫用市場支配地位等方面參與反壟斷審查的制度安排。目前已經制定發布自貿試驗區三個領域反壟斷的工作辦法，形成了自貿試驗區反壟斷審查聯席會議制度方案。
三是健全社會信用體系。4月30日正式開通上海市公***信用信息服務平臺。依托這壹平臺積極推動自貿試驗區子平臺建設，完善與信用信息、信用產品使用有關的壹系列制度。目前，自貿試驗區子平臺已完成歸集查詢、異議處理、數據目錄管理等功能開發工作，同時探索開展事前誠信承諾、事中評估分類、事後聯動獎懲的信用管理模式。
四是建立企業年度報告公示和經營異常名錄制度。企業年檢制改為年度報告公示制度後，企業通過信用信息公示系統向工商部門報送年度報告，特定企業還須提交會計師事務所出具的年度審計報告。目前，壹批未按期限年報公示的企業，已被納入首批經營異常名錄。
五是健全信息***享和綜合執法制度。在信息***享方面，重點是建設試驗區信息***享和服務平臺。目前，平臺已初步實現各管理部門監管信息的歸集應用和***享，促進跨部門聯合監管。在綜合執法方面，重點是建立各部門聯動執法、協調合作機制，包括相對集中行使執法權、建設網上執法辦案系統、建設聯勤聯動指揮平臺。
六是建立社會力量參與市場監督制度。重點是通過扶持引導、購買服務、制定標準等制度安排，支持行業協會和專業服務機構參與市場監督。目前，自貿試驗區《促進社會力量參與市場監督的若幹意見》正在征求意見。
針對《總體方案》明確的23項服務業擴大開放措施，國家主管部門和上海市已出臺14個操作管理配套文件，從投資者條件、企業設立程序、業務規則、監督管理、違規處罰等方面，對擴大開放行業明確具體監管要求，建立相應的監管制度。
法制環境建設
在國家層面，已暫時調整實施了3部法律、17部行政法規、3部國務院文件、3部國務院批準的部門規章的有關內容。上海市人大制定實施了《中國（上海）自由貿易試驗區條例》，對自貿試驗區建設涉及的制度創新內容和具體改革舉措，以地方性法規的形式進行了全面規範。