常熟市發改委(市物價局、市服務業發展辦公室、市企業上市辦公室)
常熟市經濟和信息化委員會(中小企業局)
常熟市教育局
常熟市科技局(市知識產權局)
常熟市公安局
常熟市監察局(與市紀委監委合署辦公)
常熟市民政局
常熟市司法局
常熟市財政局
常熟市人力資源和社會保障局
常熟市國土局
常熟市住房和城鄉建設局(地震局)
常熟市規劃局
常熟市城市管理局(城市管理行政執法局)
常熟市交通局
常熟市水利局(市水務局)
常熟市農業委員會(市林業局)
常熟市商務局
常熟市文化廣電新聞出版局(市文物局、版權局)
常熟市衛生局(美國食品藥品監督管理局)
常熟市體育局
常熟市環保局
常熟市旅遊局
常熟市民族宗教事務局
常熟市人口和計劃生育委員會
常熟市審計局
常熟市安監局常熟市統計局常熟市糧食局
常熟市信訪局
常熟市民防局(人防辦)
常熟市政府國有資產監督管理辦公室(與市財政局合署辦公)
註:1。()是上市公司；
2.市政府僑務辦公室是市委統戰部的掛牌機構。