1）企業管理信息系統。我國MIS早期應用於企業財務核算，隨著時代和技術的發展，MIS現已應用於物料需求計劃、制造資源計劃、企業資源計劃、客戶關系管理、供應鏈管理等不同的管理領域，並衍生出了相應的管理信息子系統即MRP、MRP II、ERP、CRM及SCM；
2）教育信息系統。隨著MIS的不斷發展，學校也開始廣泛運用，尤其是高校。目前MIS被廣泛應用於教學管理、校務管理、學籍管理、學生宿舍管理等。
3）圖書管理信息系統。隨著圖書館館藏文獻數量不斷增加，加之數字圖書館的出現，傳統的人工管理圖書館已大大影響了圖書館管理效率。因此，圖書館管理系統應運而生。現如今的圖書館管理系統融入了數據挖掘、人工智能等嶄新技術，越來越向著智能化、網格化和專業化的方向發展。