1.克隆技術應用於人體，將導致對後代遺傳性狀的人為控制。克隆技術引發的爭議的核心是是否可以允許在發育早期對人類胚胎進行基因操縱。這是很多倫理學家無法接受的。
2.克隆技術的使用將使人們傾向於在現有種群中繁殖最有價值的個體，而不是按照自然規律促進整個種群的優勝劣汰。從這個意義上說，克隆技術幹擾了自然進化過程。
技術來源
“克隆”壹詞於1903年引入園藝學，並逐漸應用於植物學、動物學和醫學。從廣義上來說，“克隆”其實是我們日常生活中經常遇到的，但不叫“克隆”。在自然界中，許多植物具有與生俱來的克隆本能，如紅薯、土豆、玫瑰等扡插繁殖植物。而動物克隆技術則經歷了從胚胎細胞到體細胞的發展過程。
多莉的基因與6歲的母羊完全相同，是她母親的復制品。值得註意的是，克隆技術不僅會給人類帶來巨大的好處，也會給人類帶來災難和問題。但是，我們不能阻止它的發展，因為它可能會帶來嚴重的後果。歸根結底，它的優點大於缺點，它將有利於人類的廣泛應用。個人(通常通過載體)然後研究或使用它。
克隆有時是指成功鑒定出某種-{A|zh-cn:表型；Zh-tw:顯性基因。所以當壹個生物學家說某個疾病的基因克隆成功了，也就是說這個基因的位置和DNA序列已經確定了。獲得這個基因的拷貝可以認為是鑒定這個基因的副產品。