1、登錄電子稅務局，左側有清稅套餐，點擊“清稅申報套餐”。
2、辦理註銷稅務登記業務前，完成《企業所得稅清算報備》、《註銷當期申報》和《居民企業清算企業所得稅申報》是居民單位納稅人註銷稅務登記的業務前提條件。完成《註銷登記當期申報》是個體、獨資、合夥企業註銷稅務登記的業務前提條件。以居民單位納稅人為例，點擊“去辦理”。
3、先填寫申請表，信息輸入完，點擊“下壹步”進入預覽界面（無需報送附列資料），預覽無誤後提交即可。
4、接著辦理《居民企業清算企業所得稅申報》，點擊“去辦理”，系統自動實際應退補所得稅額，點擊“確認發送”。（後附資產損益明細表、負債清償損益明細表、剩余財產計算和分配明細表）。
5、在電子稅務局申報完後，填寫註銷稅務登記申請審批表。主要填寫公司的基本信息、註銷原因、附送的資料，再蓋上公司的公章。稅務局收到申報表後，會核查公司的稅務有沒有辦理完畢，核查後沒有問題，就會出具壹份蓋有稅務局印章的《清稅證明》給申請人。
清稅證明可以網上打印具體操作步驟如下：
1、若未辦理過稅務登記的納稅人需要在稅務機關開具清稅證明，可直接點擊公眾服務、清稅證明（開具）、選擇辦理模式（未納稅登記）模塊辦理。
2、進入清稅證明（開具）界面，錄入納稅人識別號、法定代表人（業主）姓名及手機號，系統進壹步檢測該稅號是否符合辦理資格。
3、若輸入的稅號滿足條件，則需要上傳法定代表人（或業主）的身份證件照片和人臉影像照片，點擊“確定”按鈕完成上傳。
4、照片上傳成功後點擊“驗證/開具”按鈕開具清稅證明。點擊“打印”按鈕打印清稅證明。
企業清稅註銷所需條件：
1.無防偽稅控設備
2.無涉稅風險點
3.無未辦結涉稅事項
4.單位納稅人(非個體工商戶）
清稅證明窗口辦理流程
1、納稅人已通過電子稅務局提交資料，稅務人員通過稅源管理平臺查閱相關資料;納稅人未通過電子稅務局提交過資料，稅務人員在辦稅服務廳前臺查閱納稅人提交的紙質資料。按照以下情況分別辦理：
(1)納稅人提交資料齊全、符合法定形式的，受理申請。
(2)納稅人提交資料不齊全或不符合法定形式的，制作《稅務事項通知書》(補正通知)，壹次性告知納稅人需補正的內容。
(3)依法不屬於本機關職權或本業務受理範圍的，制作《稅務事項通知書》(不予受理通知)，告知納稅人不予受理的原因。
2、辦稅服務廳人員出具清稅證明
(1)納稅人已辦結所有稅務事項的，出具《清稅證明》;
(2)納稅人存在以下情形的，通知其存在未結事宜：
①納稅人存在未申報、欠稅信息;
②納稅人存在未驗舊的發票;
③土地增值稅納稅人未完成土地增值稅清算;
④企業所得稅納稅人未完成企業所得稅清算;
⑤納稅人存在多繳(包括預繳、應退未退)稅款;
⑥納稅人存在未結報的稅收票證;
⑦納稅人存在其他應結未結事項。
3、稅務機關確認納稅人結清應納稅款、多退(免)稅款、滯納金和罰款，繳銷發票和相關證件後，向納稅人出具《清稅證明》，提示其憑稅務機關開具的《清稅證明》辦理工商登記註銷。
法律依據
《國家稅務總局關於深化“放管服”改革 更大力度推進優化稅務註銷辦理程序工作的通知》
二、進壹步簡化稅務註銷前業務辦理流程
（壹）處於非正常狀態納稅人在辦理稅務註銷前，需先解除非正常狀態，補辦納稅申報手續。符合以下情形的，稅務機關可打印相應稅種和相關附加的《批量零申報確認表》（見附件），經納稅人確認後，進行批量處理：
1.非正常狀態期間增值稅、消費稅和相關附加需補辦的申報均為零申報的；
2.非正常狀態期間企業所得稅月（季）度預繳需補辦的申報均為零申報，且不存在彌補前期虧損情況的。
（二）納稅人辦理稅務註銷前，無需向稅務機關提出終止“委托扣款協議書”申請。稅務機關辦結稅務註銷後，委托扣款協議自動終止。
三、進壹步減少證件、資料報送
對已實行實名辦稅的納稅人，免予提供以下證件、資料：
（壹）《稅務登記證》正（副）本、《臨時稅務登記證》正（副）本和《發票領用簿》；
（二）市場監督管理部門吊銷營業執照決定原件（復印件）；
（三）上級主管部門批復文件或董事會決議原件（復印件）；
（四）項目完工證明、驗收證明等相關文件原件（復印件）。