1、職責不同。稅務稽查負責涉稅涉票案件的舉報受理、案件查處、重點稅源戶的檢查、每年上級安排的專項檢查。稅務征管人員只負責日常的辦證、申報、領購發票、納稅輔導等。
2、工作重點不同。稅務稽查的重點是納稅檢查和監督，如發票協查，結稅結票，行政處罰，稅收保全和強制執行等
稅務征管的重點是稅務管理，主要是宣傳、送達和咨詢輔導，稅務登記和認定，核定申報方式和納稅定額，發票管理，交叉稽核。
3、所屬機構不同。稽查局只是市地稅局下屬的壹個機構，如同其他地稅分局壹樣，只是稽查局的工作內容和其他分局不同。其他地稅分局主要從事稅收的征收管理工作，而稽查局則是專門從事稅務檢查工作。
擴展資料
稅務稽查包含選案、實施稽查、審理、執行四個部分。
稅務稽查的檢查工作，是根據選案所確定的稽查對象，組織稽查人員寮施檢查，采取必要的方法、措施和手段，收集案件的證人、證言，原始書證材料，整理制作《稅務稽查報告》直接將案件移送審理的活動過程。
1、檢查前的事項
稅務稽查人員在實施稽查之前，除下列三種情況之外，應當提前以書面形式向被查對象下達《稅務稽查通知書》，並要求收件人填寫《稅務文書送達回證》取回存檔。
(1)公民舉報有稅收違法行為的;
(2)稽查機關有根據認為納稅人有稅收違法行為的;
(3)預先通知有事礙稽查的;
2、回避制度
稽查人員與被查對象有下列關系之壹的，應當回避，被查對象也有權要求他們回避。
(1)稽查人員與被查當事人有近親屬關系的;
(2)稽查人員與被查對象有利害關系的;
(3)稽查人員與被查對象有其他關系可能影響公正執法的。
3、詢問
根據《稅收征管法》第三十二條規定，稅務機關在實施稅務稽查時，有權“詢問納稅人，扣繳義務人納稅或代扣代繳代收代繳稅款有關的總是和情況”。也可以對當事人、見證人或其他有關知情人，了解相關情況。
參考資料:百度百科?稅務稽查?、中國司法部?中華人民***和國稅收征收管理法實施細則