(1)審計風險高。
這種審計風險表現為固有風險、控制風險和檢查風險。從內在風險來看，由於我國部分上市公司沒有建立關聯交易的約束機制，現有法律法規除了披露關聯方及其交易外，沒有作出其他規定，因此關聯方及其交易的內在風險很大。從風險控制的角度來看，在局部利益的驅動下，關聯方交易存在相互轉移收入和費用，利用價格調節利潤的行為，使資金使用不遵循補償原則，對關聯方及其交易造成極大的控制風險。從檢查風險來看，由於部分上市公司在關聯交易上做文章，關聯交易量大且復雜，給註冊會計師設置了障礙，增加了審計證據的獲取難度，提高了關聯方及其交易審計的檢查風險。
(二)審計難度大
1.關聯方界定不清，審計難度加大。
2.異常交易增加了審計的難度。
3.未披露的關聯交易也增加了審計的難度。
(3)審計是連續的。
在關聯交易的主要項目中，如采購、銷售、應收及應付款項，壹般應披露連續兩年的可比數據。這使得在未來的年度審計過程中，上市公司變更會計師事務所時，後續會計師事務所應當按照與確認資產負債表期初余額相同的方法，獲取關於關聯方關系及其交易的初始審計證據。從關聯交易的審計實踐來看，也體現了審計連續性的特征。
3關聯交易審計的重點
(1)關聯方的識別。
關聯方審計的難點在於發現關聯方關系。只要找到所有的關聯方，審計就有了明確的線索。註冊會計師在簽署審計業務約定書和制定審計計劃時，應當全面了解被審計單位，並實施以下程序，以確定被審計單位是否存在已知或潛在的關聯方及其交易:
1，查閱歷次年度審計工作底稿。以前年度工作底稿中確認的關聯方，如果本期沒有變化，仍視為關聯方；以前年度未被記錄為關聯方的其他企業可能成為該企業的關聯方。
2.理解並評估被審核方識別和處理關聯方及其交易的程序。
3.查閱主要投資者和關鍵管理人員名單，有助於註冊會計師正確判斷其與企業的交易對企業利潤的影響。
4.查閱股東會、董事會等重要會議的會議記錄，以便註冊會計師識別控制、* *共同控制或對被審計單位施加重大影響的關聯方。
5.詢問前註冊會計師，這樣可以提高審計效率，但仍然對詢問結果進行審計。
6.審查經審計會計期間的重大投資業務或債務重組業務，確認投資和重組的性質是否構成新的關聯方關系。
7.審核所得稅申報資料。如果被審計單位納稅申報過高或過低，說明可能存在以轉移利潤為由的關聯交易。
(2)關聯交易的認定。
判斷關聯交易存在與否的標準不是金額，而是會計風險和報酬的轉移。由於被審計單位可能故意隱瞞關聯方，註冊會計師應實施特殊審計程序來識別關聯方交易。
1.查閱股東會、董事會及其他重要會議的會議記錄。
2、向有關主管部門詢問重大交易的具體情況。
3、審查被審計單位的管理說明。
4.了解被審核方與其主要客戶、供應商、債權人和債務人之間交易的性質和範圍。
5.了解是否存在已經發生但尚未入賬的交易。
6.檢查會計記錄中金額較大的異常或不經常發生的交易。
7、審核存貸款確認函，檢查是否有擔保。
(三)測試被審計關聯方內部控制制度的合規性。
1.理解並描述關聯交易的內部控制。
2.識別和確定授權或預期授權的關聯方交易。
3.抽樣檢查關聯交易原始憑證。
4.檢查董事會和關鍵管理人員提供的所有信息，以確定關聯交易的完整性。
5、審查購買和出售機器、設備或建築物的會計確認計量記錄。
6.審查關聯方之間的代理、租賃和資金借貸業務。
7.審查支付給關鍵管理人員的薪酬金額和方式是否合理。
8.評估相關方的內部控制系統。如果被審計單位的關聯交易內部控制良好，可以減少實質性測試，否則應增加實質性測試。
(四)對被審計單位的關聯交易進行實質性測試。
1.審查被審計單位與其關聯方之間的購銷活動、勞務支出和租賃業務，確定交易價格是否公允，相關原始憑證是否齊全。
2.審查被審計單位與其關聯方資金往來的相關合同和文件，核實資金是否無償占用，檢查債權債務的真實性、合法性和完整性。
3、審查相關擔保、抵押協議，檢查抵押物是否存在。
4.審查被審計方與其關聯方之間的研發項目及其轉讓價格是否偏離真實價格。
5.審查被審計單位會計報表附註是否披露了關聯交易，披露是否完整。
(5)檢查已確認的關聯交易。
在根據被審計單位關聯交易的目的、性質、範圍以及對報表的影響程度形成審計意見之前，註冊會計師還應當檢查重大關聯交易，並考慮實施額外的審計程序:
1.向關聯方查詢交易的條件和金額。
2.檢查相關方掌握的證據。
3、與經濟業務人員確認有關問題。
4.從主要往來賬戶和抵押品中獲取被審計方關聯方的償付能力。
(六)向被審計單位管理機關索取關聯方及其交易的報表，以明確註冊會計師和被審計單位管理機關各自的責任。
㈦審計意見的形成。註冊會計師應當根據審計結果形成無保留審計意見或者保留意見、拒絕意見或者否定意見。