稅務部門在納稅信用體系建設中取得了初步成果，成功構建了分級管理的基本框架，但納稅信用體系不僅僅是簡單地對企業的納稅信用等級進行評定，而是由多個相互聯系、相互制約的運行機制綜合而成的，主要包括信用保障機制、信用評價機制、信用管理機制、信息披露與傳遞機制，等等。
信用保障機制由壹套完整的法律法規體系構成，其主要功能是對信用運行機制的確立和實施提供法制保障，是整個體系正常運行的前提。納稅信用管理機制是整個納稅信用體系的核心，主要由信用信息管理、失信懲罰與守信激勵機制、信用風險預警機制等構成。主要作用：壹是收集、管理企業日常信息，通過篩選整合形成企業納稅信用信息，為信用評價機制提供真實、可靠、全面的信息依據；二是實現稅務機關對稅源的實時監控，進行高效率的稅源管理，增強抵禦稅收風險能力。評價機制目前主要以納稅信用等級評定為主，充分體現獨立性、客觀性、公正性、科學性、準確性和權威性，是信用體系的主要外在表現形式。信息披露與傳遞機制是指納稅信用體系向社會信用體系提供信用評價結果，或是與銀行信用體系、社會中介部門等各方進行信息傳遞和交換。
納稅信用等級評定工作可以說是近幾年納稅信用體系建設的中心工作。目前評價機制還存在壹些問題，主要在於對企業信用信息缺乏有效掌握和利用。從整個社會信用體系進程看，要求納稅信用體系提供更加詳實的信用評價結果的呼聲日益高漲。筆者認為，建立科學合理的納稅信用管理機制須從以下幾方面入手：
加強納稅信用體系信息化程度。信用信息管理系統是納稅信用體系運行的心臟，而納稅信用信息管理的核心是建立信用信息管理系統，該系統可以由三部分構成：壹是公***征信數據庫。要在現有的稅務部門信息數據庫和行業信用信息數據庫的基礎上建立公***征信數據庫。二是統壹的信用信息檢索平臺。信用信息檢索平臺可以由信用信息管理機構直接建立，直接管理和維護，也可以授權或委托中介機構建立、維護和管理。三是信用信息的運營和傳輸。既可以采用商業化開放經營，也可以采用特許經營方式由少數中介機構經營。計算機網絡是信用信息管理系統運作的重要基礎，是信用信息傳輸的主要通道。
建立納稅信用風險預警機制。信用風險預警機制是對納稅信用進行跟蹤與檢測，用以及時發現信用風險和處理信用風險，它是防範和控制信用風險的重要手段，是納稅信用體系不可或缺的組成部分。根據跟蹤監測對象層次不同，可以分為微觀機制和宏觀機制，分別對單個經濟主體和總體信用狀況進行評價。其建立的基礎環節是制定完整、科學且具較強可操作性的預警信號（指標），並設定臨界值。要使這些指標真正發揮作用，關鍵是建立有效的分析制度、風險暴露後的緊急應對制度等。
將失信懲罰與守信激勵同稅收管理員制度緊密結合。失信懲罰與守信激勵機制，按照作用基礎的不同，可分為兩類：壹是依靠經濟手段和道德譴責手段，在市場交易中自發地實現激勵和退出。二是由政府制定政策進行制約，使政策向誠實守信的企業和消費者傾斜，間接地降低重合同守信用企業獲取資本和技術的門檻。設計該機制時，應遵循壹個原則，即失信的“期望成本”_定要超過失信的“期望受益”，守信的“期望受益”要大於守信的“期望成本”。