清代兩廣總督府駐地
清初，肇慶是清與南明勢力的主戰區之壹，也是清與吳三桂等“三藩”的主戰區之壹，兵禍連綿近三十年。其間的順治四年（公元1647年），清以佟養甲為兩廣總督兼廣東巡撫，駐肇慶，清兩廣總督府開始設於肇慶前線，先戰南明再戰“三藩”，戰後組織區域重建，直至乾隆十壹年（1745年）才遷往廣州。在此期間，肇慶作為兩廣軍事、政治、經濟、文化中心近百年。
〖照片〗①：閱江樓清康熙禦書碑（五個）全景文字說明：清康熙四十五年始任兩廣總督的郭世隆是康熙重臣，其駐肇慶時將康熙賜給他父子的手書刻成五塊禦書碑立於閱江樓側崧臺驛，以示自己的榮寵（五碑均存於今閱江樓內）。〖照片〗②：清康熙年間肇慶府城圖文字說明：清康熙年間肇慶府城圖〖照片〗③：清雍正年間肇慶府城圖文字說明：清雍正年間肇慶府城圖。
清初肇慶經濟的恢復
經過明末清初戰亂的肇慶，民生雕蔽，“棚民”匿山抗稅。清初政府壹面設屯田兵於肇慶，兵民結合，防“匪患”促軍墾；壹面采取輕徭薄賦、加強賑災、興修水利、鼓勵墾荒、廢除匠籍（工奴）、保護工商等政策，大大加速了清初肇慶經濟的繁榮。乾隆年間刻勒的肇慶府《奉督憲嚴禁簽取各行什物碑記》等，是肇慶嚴禁官差借賒欠、封江等名義勒索商戶和商船的告示，體現了清初政府的“恤商”政策。
〖照片〗①：《磁器鐵鍋缸瓦鋪永禁碑記》 文字說明：清乾隆年間肇慶府發布的“不得藉有公務簽差，擅向鋪戶借取租賃，致滋擾累”的告示《磁器鐵鍋缸瓦鋪永禁碑記》。〖照片〗②：《奉督憲嚴禁簽取各行什物碑記》文字說明：清乾隆年間肇慶府發布的“不得藉有公務簽差，擅向鋪戶借取租賃及恃勢短價壓買”的告示《奉督憲嚴禁簽取各行什物碑記》。〖照片〗③：禁封江勒索碑 文字說明：清乾隆年間肇慶發布的“禁封江勒索碑”。
羚羊峽上望夫歸
清初肇慶商業日漸繁榮，各地商人來肇慶做生意的很多，並深入到廣寧、懷集等地的農村圩市。肇慶的商人也有很多到廣西經商，往來於兩廣之間。著名的“羚羊峽望夫歸”的傳說就是在這樣的背景下產生的。相傳，
〖照片〗①：羚羊峽望夫歸景文字說明：羚羊峽望夫歸景〖照片〗②：端硯、草席、蕉布、會紙、象牙雕文字說明：當時肇慶出名的手工業產品
清初兩廣錢幣的發行中心
康熙二十五年（1686年），兩廣總督吳興祚疏請於府城肇慶成立鼓鑄局鑄錢，肇慶成為兩廣錢幣發行中心，直至康熙四十七年（1708年）。
〖照片〗①：鼓鑄局遺址文字說明：位於今肇慶城中路肇慶中學內的清兩廣鼓鑄局遺址〖照片〗②：銅錢文字說明：清兩廣鼓鑄局鑄制的銅錢
清初兩廣規模最大的學府
清初，得益於兩廣首府地位，肇慶的書院得到前所未有的發展。康熙四十七年，兩廣總督趙宏燦於剛廢的鑄錢局舊址創設天章書院。書院藏書極豐，生員頗眾，為當時兩廣規模最大的學府。著名學者全祖望、林召棠、蘇廷魁等均曾掌教於此。天章書院於乾隆年間擴建，並改用明時最著名的“端溪書院”名稱，光緒三十壹年（1905年）又改為學制五年的肇慶府中學堂（肇慶中學前身）。肇慶府中學堂，為肇慶有近代公立中學之始。
〖照片〗①：肇慶中學內石鼓文字說明：故天章書院（今肇慶中學）內的清代石鼓〖照片〗②：蘇廷魁與壹品夫人李氏遺像（《肇慶文史》第三輯，從中取蘇廷魁，最好找到原像）文字說明：蘇廷魁，字賡堂，鼎湖長利人，清道光、鹹豐、同治三朝臣，歷任翰林院編修、禦史、河南布政使、東河總督等職。曾力主修築虎門炮臺等要塞；上書彈劾權臣穆彰阿、賽尚阿；要求道光下罪己詔，開直諫路；組織團練抗英。曾掌教端溪書院，多有著作傳世。〖照片〗③：林召棠閬風巖《狀元碑》文字說明：曾掌教端溪書院15年的清道光三年狀元林召棠書於閬風巖的“狀元碑”
清代肇慶除天章書院以外，各地書院尚有：星巖書院、三都書院、五雲書院、培風書院、桂溪書院、長溪書院、沙溪書院、文昌書院、桃溪書院、硯洲書院、九曲書院、寧溪書院、桂嶺書院、桂源書院、綏江書院、文治書院、青雲書院、景奎書院、文德書院、儲元書院、南靖書院等。星巖書院，是今肇慶壹中的前身。
〖照片〗①：懷集文昌書院文字說明：始建於明代、重建於清代的懷集文昌書院、文昌閣〖照片〗②：清五雲書院碑記文字說明：記載高要64村村民歷42春秋創建五雲書院的艱辛歷程的《清五雲書院碑記》〖照片〗③：端江義學牌匾文字說明：清星巖書院之“端江義學” 牌匾〖照片〗④：三都書院文字說明：位於黃崗，建於清代，由黃崗都、陶山都、巖前都集資興建的三都書院
“大洪國”和張國梁
鹹豐初，廣東爆發響應太平天國的紅巾軍起義，在高要伍百吉攻占肇慶城後，曾出現15路廣東紅巾軍會師肇慶東較場的盛況。鹹豐七年（1857年），三水陳金釭紅巾軍克懷集縣城，並以之為中心，建立奉太平天國為正統的“大洪國”，後因內部不和於同治二年（1863年）被鎮壓。大洪軍曾縱橫兩廣五州近二十縣，兵眾十余萬，歷時8年多。在太平天國時期，肇慶也出了壹個鎮壓太平的急先鋒，他就是鼎湖沙埔人張國梁。張國梁，字殿臣，曾參加廣西貴縣天地會起義，降清後隨廣西提督向榮轉戰廣西、兩湖和南京，為清江南大營悍將、太平軍勁敵，累軍功，自把總至都司、遊擊、副將、總兵、提督，鹹豐九年（1859年）死於太平軍第二次摧毀江南大營的戰鬥中。被清廷追認為壹等男爵、忠武公。
〖照片〗①：肇慶東較場 文字說明：曾15路廣東紅巾軍會師肇慶賀新春的肇慶城東較場〖照片〗②：懷集大洪國史跡文字說明：〖照片〗③：清代嘉慶年間鑄造的火炮文字說明：清代嘉慶年間鑄造的火炮〖照片〗④：張忠武公祠古井文字說明：今閱江樓東側原有張忠武公祠，建於鹹豐十年，祠現已毀，僅存此井，稱“張忠武公祠古井”。
光緒年間的肇慶近代化
光緒十九年（1893年），地方官創辦有線電報局於城中路包公祠左，是為本地有電報之始。光緒二十三年（1897年），廣州、肇慶間的“肇省渡”拖輪創設，是本地有民用機動船之始。光緒二十九年（1903年），康有為學生、鼎湖硯洲人陳煥章在鄉創辦穎川兩等學堂，是為本地有新式近代學堂之始。光緒三十年（1904年），大清郵局創設於肇慶城東門外，是為本地有近代郵政之始。
〖照片〗①：陳煥章肖像文字說明：陳煥章，字重遠，鼎湖硯洲人，曾師從康有為。1905年奉派留美，是全國第壹個兼有清廷進士、西洋博士身份的人。曾擔任過蔣氏“總統”顧問。1933年卒。〖照片〗②：陳煥章故居文字說明：位於鼎湖硯洲的陳煥章故居〖照片〗③：康有為題寫的硯洲“勵剛家塾” 文字說明：康有為題寫的硯洲“勵剛家塾”〖照片〗④： 文字說明： 〖照片〗⑤：文字說明：
捍衛西江緝捕權的鬥爭
清光緒二十三年（公元1897年），中英訂立《西江通商專約》，開放肇慶、德慶等四個口岸。光緒三十三年，英商輪“西南”號在高要、高明交界的黃坑口被劫。英駐香港領事以“西江流域盜風不靖”為由，威脅兩廣總督潘人駿，將西江緝捕權交給英控海關稅務司，並派出九艘戰艇的海軍編隊強行駛入西江，英兵侵入肇慶街市，又在港口強行搜查旅客，開炮威脅肇梧渡輪，在封川擊沈我油船壹艘。肇慶各界集會、通電抗議，兩廣“群情洶湧”。經兩廣各界抗爭兩月余，英艦退出西江。
〖照片〗①：黃坑口文字說明：英商輪“西南”號被劫的黃坑口〖照片〗②：抗議通電文字說明：
同盟會肇慶支部與肇慶獨立
宣統辛亥年（1911年），高要人陳子昂在黃花崗起義失敗後潛回家鄉，組織同盟會肇慶（高要）支部（設祿步圩），在肇慶府中學、廣肇羅工藝學堂等學校發展會員，在肇慶清軍官兵中開展策反工作。11月9日，在同盟會的反復策動下，清軍肇慶巡防營統帶隆世儲率所部三個營、水提親軍營管帶李耀漢率所部壹個營與開入肇慶的民軍聯合，在肇慶宣布獨立，歸附獨立的廣東軍政府。肇慶脫離清政府統治。李耀漢，字子雲，廣東新興人，曾為匪，受招安而為清肇慶巡防營管帶，參加過辛亥革命、護國戰爭、護法戰爭、粵桂戰爭，為肇慶辛亥起義領導者之壹、肇軍創建人之壹，曾借肇軍勢力而任署理廣東省長（北京政府授其廣東省長、廣東督軍、上將，未受），又借省長之權，創肇軍講武堂，擴充肇軍，後在與桂系的爭鬥中失敗，勢力大弱，漸非實力人物。1942年卒。