歸口管理是壹種管理方式，壹般是按照行業、系統分工管理，防止重復管理、多頭管理。歸口管理實際上就是指按國家賦予的權利和承擔的責任、各司其職，按特定的管理渠道實施管理。
根據您所說的：“重大違紀（通報及以上處理）處理檔案（包括原始記錄、調查材料、處理意見及最終處理結果等文字、音像材料）應壹案壹檔，統壹歸口管理，長期保存。”
可以理解為：每個重大違紀行為建立各自的檔案，並由專門部門進行統壹管理，避免因檔案遺失、錯放等不當處置，影響後期的檔案查詢、調用等。
例1：
例2：
擴展資料：
歸口管理在工作中的地位：
《辭海》裏對“歸”有壹種解釋是“專任”；“口”有壹種解釋是“渠道”。歸口管理是管理的基本手段，實質是讓專業部門管理其擅長的工作。該管的壹定要按責任劃分管好，不要缺位；不該管的不要亂插手、亂幹預，不要錯位；超出責任權限範圍的，不能亂審批、不要越位。
例如：工商稅務不能混為壹談；公安、法院、檢察院不能混為壹談；要各負其責、各司其職。
對於檢察機關來說，案管部門相當於整個檢察機關的程序性事務總管，負責受理、分配和流轉案件，對檢察機關各類案件實行統壹歸口管理。
水利部引進國外智力領導小組辦公室（水利部引智辦）設在國際合作與科技司。國科司是水利部引進國外智力工作的歸口管理部門。
四川省仁壽縣人民檢察院-司法體制改革背景下對基層檢察機關案管工作開展路徑的思考
百度百科-歸口管理