1，報告主題不同。
會計報表年度審計報告由會計師事務所出具，企業所得稅年度鑒證報告由稅務代理機構出具。
2.使用報告的部門不同。
審計報告的使用部門不僅包括企業的管理機關，還包括提供給相關主管部門，如市場監督管理局、稅務部門、外匯管理部門、金融機構等。，而稅務審計報告只能提供給企業的主管稅務部門。
3.審計的範圍和內容是不同的。
出具審計報告時，必須對企業年度會計報表中的所有項目進行全面審計，獲取充分、必要的審計證據。審計報告包括對企業相關流轉稅和企業所得稅項目的審計，而稅務審計報告只對企業所得稅進行單項核查，包括企業所得稅應納稅所得額、增減項目、適用稅率和未繳情況。
4.不同的工作方法
會計師事務所在出具審計報告時，應當獲取大量充分、必要的審計證據，如往來賬戶查詢、實物資產清查等。稅務審計報告主要側重於審計和計量相關的涉稅會計記錄。
擴展數據
需要制作審計報告的企業:
1.壹人有限責任公司(即全資自然人企業或私人有限責任公司)；
2.外資企業；
3.上市股份有限公司；
4.從事金融、證券、期貨的公司；
5.長期負債或虧損的企業；
6.從事保險、創業投資、驗資、評估、擔保、房地產經紀、出入境中介、境外勞務代理、企業登記代理的公司；
7.註冊資本未分期繳足的公司；
8.虛報註冊資本、虛假出資或者三年內抽逃出資的公司。
需要制作稅務審計報告的企業:
1.企業當年虧損較大，需要次年彌補虧損的，需要出具當年稅務審計報告；
2.企業的會計處理可能存在問題。如果企業不放心，也會選擇稅務代理機構的稅務審計報告；
3.企業核算沒有問題，但當年增值稅稅負較低，可能會引起稅務機關的註意。這時，企業可以考慮稅務審計報告；
4.企業連續三年虧損的，稅務局會通知企業出具三年稅務審計報告，因納稅評估面談等原因，稅務局會通知企業出具稅務審計報告；
5.企業當年盈利，但是利潤太低，收入和資產不匹配，或者企業偷稅漏稅比較多。為了稅務安全，怕被稅務機關檢查，會主動選擇做稅務審核；
6.企業當年有盈利的，需要彌補以前年度虧損的，應當在當年和每年年中需要彌補以前年度虧損時出具稅務審計報告。
參考資料:
百度百科-財務報告