2.增值稅稅率不同:小規模納稅人壹般按3%征收(2020年1%)。壹般納稅人壹般按6%、9%、13%征收。
3.發票權限不同:小規模納稅人銷售貨物只能開具普通發票，不能開具增值稅專用發票。壹般納稅人銷售貨物既可以開具普通發票，也可以開具增值稅專用發票。
4.進項稅抵扣:小規模納稅人取得增值稅專用發票時不能抵扣進項，只能作為應納所得稅的成本抵扣，而壹般納稅人取得增值稅專用發票可以作為當期進項稅抵扣。
擴展數據:
企業在稅務園區設立小型個人獨資企業的，不需要繳納企業所得稅，但繳納個人營業所得稅，享受核定征收。已批準發票金額的10%用作利潤稅。個人業務所得稅核定後在0.5%-2.19%之間。開票金額越高，稅率越高(年開票金額在500萬以內)。加上增值稅和附加稅，總體稅負不超過5%，大大降低了企業總體稅負。
企業在稅務園區新設立公司、分公司或子公司，並在設立後正常納稅的，當地園區給予企業壹定比例的資金支持和獎勵。增值稅和企業所得稅獎勵返還。
增值稅地方留成40%-80%獎勵扶持；企業所得稅地方留成40%-80%獎勵扶持。
小規模納稅人多適用個人獨資企業的核定征收政策，壹般納稅人多適用有限公司的獎勵返還政策。但也有普通納稅人設立個人獨資企業是為了減稅。比如壹般納稅人設立個人獨資企業享受核定征收，征收方式與小型個人獨資企業相同。