納稅申報有兩種:紙質和網上。
1.紙質申報:
這種申報方式只針對輔導期的企業。填完五張表(壹式兩份)，帶上復印好稅款的IC卡，先交給管理員或值班人員審核比對認證結果，再到申報征收窗口進行納稅申報；
五種表格分別是:主表、進項稅明細表、銷項明細、專用發票申報抵扣明細和專用發票存根聯明細。
2.在線申報:
這種申報方式針對的是除輔導期以外的普通納稅人。可以進入網上申報系統按照提示進行申報，然後打印出申報返回的結果，到稅務局領取IC卡。
增值稅副本和納稅申報流程
抄稅是指開票單位將防偽稅控中開具的增值稅發票信息讀入企業開具發票使用的IC卡中，然後將IC卡拿到國稅局讀入他們的計算機系統。
為了將發票與國稅局計算機系統記錄的信息進行比對，防止企業開具陰陽票和大頭小尾票，控制企業銷售收入。
稅務復制操作
應該是報稅、抄稅、認證，這是增值稅防偽稅控系統每個月必須做的工作，金稅工程所屬的開票、認證系統的工作。按照具體的操作順序:
1.復制稅:
(1)用戶復制報稅流程
抄稅寫IC卡-打印各種報表-報稅
a、在抄稅開始日進行正常的抄稅處理；
進入系統-報稅處理-報稅復制管理-報稅復制處理-系統彈出“確認對話框”-插入IC卡並確認-IC卡復制成功。
B.反復抄上個月的舊稅:
進入系統——報稅處理——報稅復制管理——報稅復制處理——系統彈出“確認對話框”——插入IC卡，確認上月舊稅復制成功。
c、金稅卡狀態查詢
進入系統-報稅處理-金稅卡管理-金稅卡狀態查詢-系統彈出詳細信息。
2.報稅:將復印好的IC卡和打印好的輸出報表到稅務局辦稅服務廳交給受理報稅的稅務人員，他們會按照報稅系統的要求為妳報稅，也就是讀取妳IC卡上的開票信息，然後與各種輸出報表核對，再進行報稅。
3.認證:認證時，可攜帶當月待抵扣的增值稅發票，鏈接到國稅局發票認證窗口進行處理。增值稅專用發票自開具之日起180日內有效。當月認證的，當月必須扣除。
網上報稅的簡單操作流程
(1)基本要求和步驟
1.實行網上納稅的納稅人，應先登錄國家稅務總局網站進行註冊(電腦用戶註冊、打印協議、稅務局蓋章生效、開戶)，獲取用戶名和密碼。
2.連接互聯網，打開網頁瀏覽器，進入國家稅務總局網站。
3.在車站首頁點擊網上辦稅菜單，進入網上辦稅大廳，輸入用戶名(即稅務登記號)和密碼，點擊登錄按鈕，進入網上辦稅大廳進行業務操作。
(二)壹般納稅人網上報稅流程(以增值稅申報為例)
1.點擊申報征收菜單，進入申報界面，左側顯示企業可以申報的稅種。選擇壹般納稅人的增值稅申報，點擊輸入申報按鈕。
2.彈出統壹對話框:上傳申報描述文件。該文件存儲在與聲明文件相同的位置，文件名為“RepFileInfo”。Xml”。單擊瀏覽，選擇文件，然後單擊確定上傳文件。
3.申報描述文件上傳成功後，系統會自動跳轉到“申報文件上傳”界面。根據系統給出的需要上傳的文件類型，點擊“瀏覽”按鈕，逐壹選擇需要上傳的文件，點擊“確定”按鈕。
按鈕，系統會彈出您所有報告的名稱進行確認。確認後點擊確定，系統會彈出“文件上傳結果”頁面。如果上傳成功，會提示“文件上傳為”
工作，後臺正在處理申報，稍後可以通過申報結果查詢功能查詢結果。"
4.用戶可以通過壹般納稅人的申報結果查詢獲得處理後的申報結果。如果申報結果提示申報成功，他們可以進行“繳稅”操作。
5.進入繳稅功能。可以從“申報領取”首頁輸入，也可以在申報成功後輸入。
6.網上繳稅頁面顯示的是企業的欠稅信息列表，在“待繳稅”壹欄可以查看某個稅種的欠稅明細。
7.點擊“繳稅”按鈕，系統會彈出詢問是否確定繼續。點擊“確定”按鈕，系統將自動從您的銀行扣款。
8.如果系統提示扣款成功，說明本次已經全額扣款，用戶已經完成網上報稅的所有操作。此時，您可以點擊“註銷”按鈕退出網上辦稅大廳。
需要註意的事項
壹般納稅人須於每月1日復印防偽稅控開票機稅款，在稅務機關規定的納稅申報時間前到辦稅服務廳綜合辦稅窗口1-10號、企業開具窗口1-12號或13-14號。