鄞州區地處中亞熱帶東部常綠闊葉林，地質、土壤、氣候、生物等因素的綜合作用，給植被生長創造了有利的條件。已鑒定植被種類中，有維管束植被151科，896種，其中蕨類植物24科，92種；稞類植物8科，44種；被子植物19科；760種；苔蘚植物48科，165種。森林木本植物以殼鬥科、樟科、山茶科、木蘭科和冬青科居多，其次為薔薇科、杜鵑花科、豆科、茜草科、金縷梅科、大戟科、忍冬科、木犀科和野萊莉科等。第四紀大冰期的冰川未嚴重破壞鄞州區植被，因而鄞州區多遺存古老的殘遺種和古樹珍貴樹木，在植物區系中占有最大比重的被子植物，也含有不少古老的類型。榆科、杜英科和椴樹科等在白堊紀後期陸續分化出來的科、種在鄞州區分別有10種、4種和1種。鄞州區山區現存的銀杏、香果樹和金錢松屬於國家二級保護植物，天日目蘭、紅豆樹等為三級保護植物。此外還保存著壹千多年生長歷史的“唐柏”、香樟，以及栽植於明、清朝的古松等。鄞州區植被擁有較多數量的特有種、單種屬和少種屬。鄞州區經濟植物中，用材樹種有100多種；藥用植物有絞股藍、杜仲等402種；澱粉類植物有殼鬥科等80種；芳香類有木蘭科、樟科、芳香科、傘形科等61種；油脂類植物有72種，纖維植物100多種。
鄞州區的植物區系地理成份復雜，熱帶成分占優勢。泛熱帶成分、熱帶美洲和熱帶亞洲成分、舊大陸熱帶成分、熱帶亞洲、熱帶澳洲成分在鄞州區森林植物區系成分中占有主要比重。另外，東亞成分在鄞州區也較突出。此外，該縣植物區系有許多種類屬於東亞——北美間斷型的。還有北溫帶成分的如松屬、刺柏屬等裸子植物等。體現了從熱帶向溫帶的過渡性質以及東亞植物區系的區域的特征。
鄞州區植被在長期開發中已逐步人工化，原生植被幾乎破壞殆盡，殘存的半原生植被也為數無幾，僅在天然林場和少數交通閉塞的山地有小片半原生狀態的常綠闊葉林。大部分丘陵山地多為次生的針葉林所覆蓋，鄞州區的植被可分為二類，壹類是自然植被類型，主要有亞熱帶針葉林（馬尾松林、杉木林、柳杉林、黃山松林、金錢松林），常綠闊葉林，落葉闊葉林、常綠闊葉落葉混交林，針、闊葉混交林，竹林，灌草叢等組成；另壹類是人工栽培植被。 該區野生動物在地理分布上屬東洋界區系，歷史上動物資源豐富。由於森林資源破壞嚴重，山區的野生動物棲息場所和活動範圍縮小，加之人為的亂捕濫殺，動物資源日益減少，平原地區在平整土地中拆除大批墳灘，使小動物失去棲息之地。
脊椎動物中，哺乳類多分布於丘陵低山地區。今境內偶有發現毛冠鹿和金錢豹，為國家壹類保護動物；獐為二類保護動物。80年代後由於封山育林，各種動物又見增加，常見有14科28種。在鄞州區常見鳥類有34科48種，棲息、活動於山林及水邊。1988年調查發現境內常見鳥類基本為食蟲類鳥類，常見的食肉類鳥類如鷹科的裊等在70年代初就基本絕跡。鳥類中白鸛為國家壹類保護動物；松鴉和環頸雉為國家二類保護動物。區內常見的爬行類動物7科13種。兩棲類以蛙為主，分布在水稻及棉花地區，山溪濕地也常見。虎紋蛙為國家二級保護動物。常見蝦蟹類有8科9種。
節肢動物常見的有中國鱟、圓蜘蛛、娛蟻等，環節動物有螞蟥、蚯蚓和海蜇等。
昆蟲中有蜻蜒、蜜蜂、螳螂、草始、寄生蜂、紫膠蟲，白臘蟲和家蠶等。 鄞州區年平均水資源總量為11.07億立方米，其中地表水10.28億立方米，地下水0.79億立方米。由於江河貫穿境內，年出入境水量甚為可觀，多年平均年入境總水量為20.76億立方米，出境總水量（含過境水量）達27.73億立方米。
根據鄞州區的地理特征，水資源包括江、湖、河及地下水。以鄞東山地的明閣樓――望海峰――白巖山壹線為分水嶺，西部為甬江水系，東部為大嵩江水系，甬江水系是鄞州區的主要水系。
鄞江奉化江支流，發源於四明山中的白肚腸崗麓，越鄞江鎮它山堰後河流為鄞江，主幹全長10.8公裏，河床平均寬度62米，深2.4米，河道坡道平緩，平時為淡水，大旱年鹹潮可上溯響巖附近。鄞江全流均在境內。
奉化江發源於四明山的秀尖山東南麓的刻江，在區境內匯西來的鄞江與南來的東江後始稱奉化江（南三江口），東北向流向寧波市。奉化江自南三江口後完全進入區境，水流平緩，兩岸平原如砥，江道曲折蛇行，***經八彎至寧波市區，江段長27公裏，均寬208米，均深3.5米，水面面積5.62平方公裏。
姚江源出余姚市四明山北麓的白巖尖，至歧陽
五洞閘附近入鄞州區，作為界河，至望春金仙廟出境。境內江段長18公裏，水面面積4.95平方公裏，均寬275米，均深7米。其地水闊岸平，江道平緩通航。現為蓄淡江道，在鄞州區境內建翻水站二處，可翻水550萬立方米左右。
大嵩江鄞州區第二水系。上遊亭溪源於雙石嶺五都頭，在育王楔與自南而來的梅溪合為大嵩江。全長21.2公裏，均寬68米，均深3.2米，水面面積1.44平方公裏。1974年在江攙頭建15孔大型水閘l座，使江道成為淡水河。平原江道兩岸有江塘保護。
鄞東與鄞西均形成三條幹流大河，鄞南無大河，各河經楔閘獨自入江。
鄞西河流包括上接樟溪，自它山堰上遊分流處起（《鄞州區通誌》謂光溪橋起）自南水門入寧波市區的南塘河、發源於草灣崗山麓橫貫鄞西平原中部的中塘河和源出大隱，至望春橋與中塘河匯合後入寧波市西門口的西塘河。鄞東河流包括發源於金峨鄉道成嶴九闊嶺（橫溪水庫）的前塘河、承東錢湖之水自莫枝至橫石橋與前塘河匯合的中塘河和源出天童山的後塘河（上遊建三溪浦水庫）。
東錢湖位於鄞東平原中部，東西寬6.5公裏，南北3.5公裏，湖岸線長45公裏，水面面積19.89平方公裏，是浙江省最大的淡水湖泊之壹。湖東、南兩面為天臺山余脈，西北部隔零星平原孤丘與廣闊的鄞東平原相連。全湖分外湖、谷子湖、梅湖三部分。梅湖於1960年圍墾成農田。流域面積81平方公裏。東錢湖是壹個以灌溉為主，結合淡水養殖、城市供水和航運交通等綜合利用的湖泊，河湖間築有7道堰壩以溝通船舶航行，並有楔閘5座，每秒排泄總流量63.4立方米。環湖諸山之水匯成72條溪流，瀦蓄於東錢湖，並經五個楔閘流入鄞東河網。
鄞州區地下水天然資源量為7862.85萬立方米/年，其中低山丘陵區為6294.30萬立方米/年，平原區為1568.55萬立方米/年。地下水可利用水量為2863萬立方米/年，其中分布於有集中供水條件的單井出水量大於100立方米/日的宜井地段，總水量為1858萬立方米/年，不宜井地段可利用資源為1005.44萬立方米/年，其中丘陵山區為805.34萬立方米/年，
平原區為200.1萬立方米/年。鄞州區有深層承壓淡水122.6萬立方米，灌溉回歸水1038萬立方米/年。 鄞州區已發現的礦藏有泥炭、鐵、錳、銅、鉛、鋅、螢石、明礬石、粘土、石材、砂石、海鹽等20余種，近百處產地。其中金屬礦大多是礦（化）點，尚無開發利用的價值，有關部門註目於伴生的貴金屬金、銀的綜合評價，可望有新的突破，非金屬及建材礦產在境內占有優勢。主要有以下壹些：
泥炭分布於望春與東錢湖兩地。以望春山泥炭為佳。瑩石俗稱砩石。鄞州區有螢石礦產地13處。已經開采和具有進壹步探采價值的螢石礦產地有歧陽周家浦、白嶽徐家、鳳嶴藤嶺、鳳嶴嶺墩、梅園南吞、鄞江橫嶺頭、龍觀大路沿、塘溪大碧浦等8處。其中藤嶺與周家浦屬小型礦，分別由縣辦砩礦與歧陽鄉地方開采。
明礬石產於橫溪鎮南鳳凰山。
粘土、粘土類礦產分別有：高嶺土（鳳凰山、望春山）、膨潤土（五鄉石山弄）、地開石、葉臘石（大嵩球山）、粘土（莫枝大堰頭陶公山、杖錫，蜜巖、鄞江、韓嶺等地）等。隨著應用領域擴展，也包括了黃（紅）土、水底淤質土、紫砂土
（鄞西山地毛夾嶴、天打巖、龍觀到雪嶴）等。
建築石材：鄞州區建築石材開發歷史久遠。以鄞江橋所產的小溪石和梅園鄉產梅園石較為聞名。小溪石巖石層理薄且均勻，近於水平，節理少，可直接順層剝制板材，或加工成條石、塊石，用於建房，鋪路、架橋、築塘堰、鑿刻碑牌等，銷寧波等地。梅園石產於梅園山采場，巖石為褐灰色凝灰巖。因單層厚度較大，難以順層剝成板材，但可按任工，加之石質均勻細密，作碑碣裝飾雕刻甚佳。
砂石：鄞州區砂石主要產於余姚江、奉化江、大嵩江中上遊河床及河漫灘。用於鋪路及建築政體骨料。除本地民用外，大多運銷甬滬等地。 鄞州區海域分布於最東端，屬象山港海灣的壹部分，面積為53.5平方公裏，其東北為北侖區海域，西南為奉化縣海域，東南為象山縣海域。海水平均深度約10米，南端最深處可達23.5米，平均潮差3.20米。最高潮位與最低潮位之間灘塗總面積1.63萬畝（12.2Km2），可利用面積0.55萬畝，其中0.22萬畝已被利用，海塗與海底平緩，向南東傾斜，底質由粉砂質淤泥構成。其間零星散布7處石質島礁。
鄞州區海岸線總長25.66公裏，由海塘及山腳線組成，其中海塘21段***24.3公裏。區境內有淺海水面14097畝，內陸水面93571畝。壹年中適宜於魚類生長繁衍的天數達到43天，全年月平均最低水溫為6.2℃，月平均最高水溫為31~33.8℃。5~9月氣候溫和，豐沛的雨水為內陸水體補充了水源和營養物質，正好適應了魚類生長、活躍、攝食量最大的特點。定點抽樣測定，證
明內陸水域水體水質肥沃，故動物性和植物質的餌料均較豐富。淺海海水水體交換及時，各種指標適於水生動植物繁殖生長。
境內水產品有魚類、甲殼類、貝類、藻類。分布在內陸淡水、海淡水潮汐的奉化江，海水象山港。內陸淡水以東錢湖為典型的河湖水體，其水產品由中國江河平原系復合體，南方熱帶平原系復合體，古代第三紀復合體，海水復合體和北方平原復合體五個魚類系組成。1982年和1987年全縣采樣得到的魚類83種，分屬9目20科，其中鯉形目60種，鯉科52種。甲殼類3種，爬行類3種，兩棲類2種，軟體動物15種；由於潮汐江特點，甬系水系各段生態環境不盡壹致，魚類區系組成屬華東江淮亞區，逐步向華南區浙閩亞區過渡的中間類型。具有鄞州區內陸淡水五個區系復合體外，還有中印山區區系體（如纓口鰍）；象山港水域有水產品338種，其中魚類120種，貝殼90種，甲殼類90種，藻類30種，鄞州區沿海常見的有54種。