增值稅專用發票認證抵扣時限為自開具之日起180日內到稅務機關認證。認證通過後，納稅輔導期未管理的壹般納稅人，應在認證通過後的次月申報期內向主管稅務機關申報抵扣進項稅額；管理納稅輔導期的壹般納稅人，只有在跨審比對無誤後，才能抵扣進項稅額。
壹般納稅人有真實交易，但由於客觀原因，增值稅專用發票、海關進口增值稅專用繳款書等扣稅憑證逾期。經主管稅務機關審核並逐級上報，經中華人民共和國國家稅務總局認證審核後，允許納稅人繼續抵扣其進項稅額。壹般納稅人因客觀原因以外的其他原因未能認證或申請比對的，不予抵扣進項稅額。
法律依據
中華人民共和國增值稅暫行條例
第四條除本條例第十壹條規定的情形外，納稅人銷售貨物、勞務、服務、無形資產和不動產(以下簡稱應稅銷售額)的應納稅額，為當期銷項稅額減除當期進項稅額後的余額。應納稅額的計算公式:
應納稅額=當期銷項稅-當期進項稅
當當期銷項稅額小於當期進項稅額時，不足部分可結轉下期進壹步抵扣。第十壹條小規模納稅人的應稅銷售行為，實行簡易方法根據銷售額和征收率計算應納稅額，不得抵扣進項稅額。應納稅額的計算公式:
應納稅額=銷售額乘以征收率
小規模納稅人的標準由國務院財政、稅務主管部門規定。第十五條下列物品免征增值稅:
(壹)農業生產者銷售的自產農產品；
(二)避孕藥品和器械；
(3)古舊書籍；
(四)直接用於科學研究、科學實驗和教學的進口儀器設備；
(五)外國政府和國際組織無償提供的進口物資和設備；
(六)殘疾人組織直接進口的殘疾人專用物品；
(七)出售自用物品。
除前款規定外，增值稅的免稅、減稅項目由國務院規定。任何地區和部門不得規定免稅、減稅項目。