稽查局更側重稅收業務，特別是財會、稅收業務，而國稅局更側重於管理。
從鍛煉人的角度，稽查局更好些，從個人今後晉升、發展上，國稅局可能更好些。各有利弊，各有千秋吧。起草稅務稽查法律法規草案、部門規章及規範性文件;組織擬訂並完善稅務稽查工作規程及選案、檢查、審理、執行各環節相關業務規定;對稅務稽查法律法規、部門規章及規範性文件在執行中的壹般性問題進行解釋;
協同立法、公安、檢察和審判機關及其他有關部門解決稅務稽查和涉稅刑事案件的法律適用和司法解釋問題。
組織、協調、督辦稅收違法案件的查處。
參與重大稅收違法案件的審理工作;組織實施處罰聽證。
擬訂並組織實施全國稅收專項檢查工作計劃，牽頭組織全國或地區性稅收專項整治工作。
協調稅務稽查中的司法工作;參與稅務治安的協調工作。所謂派駐企業的專管員應該說的是稅務機關的駐企組，而不是稽查局。基層分局和稅源管理科、駐企組都是屬於稅源管理部門，是在稅收的第壹線的，而稅務稽查可以說是稅收管理的最後壹道環節。稅源管理部門直接和納稅人打交道，分局還要承擔辦稅服務廳的職能，如果人手不夠比較辛苦。
稽查局主要職責我引用壹下總局的解釋：稽查業務管理、稅務檢查和稅收違法案件查處；凡需要對納稅人、扣繳義務人進行賬證檢查或者調查取證，並對其稅收違法行為進行稅務行政處理（處罰）的執法活動。也就是說這是壹個執法部門。
稽查局對稅務幹部的業務能力和綜合素養要求比較高，比其他部門都好，但是難進。壹般新人進來是不會直接分配妳去稽查局的，是要有壹定工作經驗和較強工作能力的。不過作為新人去稅務分局或者大廳比較能鍛煉人，熟悉各種業務，對未來的發展更有利。稅務稽查是稅收征收管理工作的重要步驟和環節，是稅務機關代表國家依法對納稅人的納稅情況進行檢查監督的壹種形式。稅務稽查的依據是具有各種法律效力的各種稅收法律、法規及各種政策規定。具體包括日常稽查、專項稽查和專案稽查。
國家稅務局是行政單位，不是事業單位(國家稅務局下設的學校、培訓中心等才是事業單位）。 國家稅務局實行中央、省、市縣的垂直領導體制。1994年實行分稅制改革時，將原來的稅務局分設為國家稅務局和地方稅務局。
民間有要求將國家稅務局與地方稅務局合並的呼聲。國家稅務局主要負責征收中央稅以及中央與地方***享稅等稅收，地方稅務局主要負責征收地方稅等（詳細分工略）。國家稅務局與北京的國家稅務總局是兩個不同的概念。