第壹步、進入三方協議登記維護模塊
進入電子稅務局客戶端軟件，打開涉稅辦理壹稅務登記壹三方協議登記維護，點擊“三方協議登記維護”，打開三方協議登記維護表；
第二步、操作三方協議登記維護
該模塊初始化後，如果納稅人沒有存款賬戶賬號報告信息，軟件會提示“請維護存款賬戶賬號報告模塊”，需到涉稅辦理壹稅務登記壹存款賬戶賬號報告模塊維護納稅人存款賬戶賬號等信息。
第三步、保存三方協議信息
（1）納稅人存在存款賬戶賬號報告信息但沒有維護三方協議信息
1、選中數據行，點擊生成三方協議號按鈕，即從金稅三期核心系統獲取三方協議號，自動賦值到當前行的三方協議號處。
2、單擊（開戶銀行所在行政區域、銀行行別、開戶銀行（營業網點）、繳款賬號名稱、繳款賬號）任意列，彈出存款賬戶報告信息，選擇後自動賦值到當前數據行。
3、納稅人需要手動輸入開戶銀行所在區縣、清算銀行賬號、開戶銀行行號、批扣標誌。數據錄入完畢後，點擊保存按鈕，該條三方協議信息進入電子稅務局稅務局端系統待審核。
（2）納稅人已維護三方協議信息
1、可以選中已經存在的某條數據行進行修改三方協議信息，修改後點擊保存按鈕，保存後，不需要稅務局端審核，可直接打印委托扣款協議書到開戶銀行（營業網點）辦理三方協議登記。
2、也可以通過點擊增加行按鈕，新增加壹行三方協議信息，新增的協議信息狀態為未驗證，完善該三方協議信息保存。
3、對新增加壹行的三方協議信息，如果想放棄編輯該行數據，可以通過選中當前行，點擊刪除行按鈕，刪除此行三方協議信息。
第四步、打印委托扣款協議書，辦理三方協議登記
1、查詢三方協議登記是否審核
打開信息查詢壹事項進度查詢壹事項進度查詢，點擊“事項進度查詢”選擇事項大類為網簽三方協議，事項小類為網簽三方協議，調整申請日期起止，點擊查詢按鈕。在查詢結果中查看[辦理信息]列，
1、如顯示辦結（審核通過），即稅務局端審核通過，可以進行打印委托扣款協議書，去銀行辦理三方協議登記。
2、如顯示等待預審，即稅務局端還未審核該三方協議信息，需要等待稅務局端審核。
3、如顯示不預受理，即稅務局端已經審核且未通過，需要重新提交三方協議信息。
2、打印委托扣款協議書
點擊保存完畢的三方協議信息數據行先點擊打印三方協議按鈕，彈出委托扣款協議書，點擊打印按鈕，進行打印。打印完畢後，攜該委托扣款協議書到開戶銀行（營業網點）辦理三方協議登記；待開戶銀行辦理三方協議登記後，納稅人需在電子稅務局軟件該模塊中對該行數據，做驗證操作。已經上線網簽功能的銀行，稅務局端審核通過後不需打印紙質協議前往開戶銀行進行維護，可直接點擊
驗證按鈕進行驗證，可將三方協議電子信息，直接傳送給商業銀行。