所謂股權分置改革就是在法人股由非流通股轉化為流通股的過程中，法人股與流通股股東之間需求和利益的均衡。即在認可流通股含權的條件下，在法人股轉化為流通股過程中，法人股股東向流通股股東支付含權價差，在全流通條件下實現同股同權同價。由於流通股的股票價格高於非流通股價格，非流通股獲取流通股的條件就是要通過協商向流通股股東出讓部分利益，這部分利益就是對價。很清楚，對價是非流通股股東為獲取流通權向流通股股東所出讓的利益，這也正是股權分置改革的核心內容。在實際中，對價的計算是復雜多變的。對價的支付方式既可以是股權，也可以是現金。
舉例說明，假設某公司總股本15000萬股，其中國有股及法人非流通股為10000萬股，流通股為5000萬股；其調整後每股凈資產為2元，流通A股的日均價為3.5元。
假如該公司的全部非流通股股份以配售給流通股股東的方式實現全流通，那麽，該公司流通A股市值為：3.5元×5000萬=1.75（億元）；非流通股的配售價為（有的考慮市值）：2元×10000萬＝2（億元）；該非流通股全部配售給流通股東後的價值為：1.75＋2＝3.75（億元）；則配售全流通除權後每股市價為：3.75億元÷15000萬股＝2.5（元/股）。
在這裏，非流通股的股東是不能直接向二級市場拋售股票的，只能按照2元的價格全部配售給流通股股東的方式實現全流通，全流通後每股股價為2.5元。因此，應將這兩者的差額，即每股0.5元，總額為0.5億元（0.5元×10000萬）的差價總額補償給流通股股東，然後非流通股即可流通。
從上述分析可知，對於支付對價的非流通股股東來說，應該是對流通股股東的壹種股權轉移或資金補償，實質上屬於壹種增加投資成本的支出行為，而對於獲得對價的股東來說，是壹種接受補償取得收入的行為。因而，在稅收上主要涉及資產產權轉移應該繳納的印花稅和收入與支出方面涉及的企業所得稅等兩種稅收。
按照財政部、國家稅務總局《關於股權分置試點改革有關稅收政策問題的通知》（財稅〔2005〕103號）文件規定，對於接受對價補償的流通股股東，可以暫免征收應繳納的企業所得稅和個人所得稅。同時，因非流通股股東向流通股股東支付對價而發生的股權轉讓，雙方暫免征收印花稅。