申請個人所得稅免稅可以在手機上實現，有以下步驟:
1，打開手機，安裝個人所得稅手機APP；
2.打開個人所得稅手機APP軟件，找到“個人中心”界面，註冊；
3.回到首頁找到扣款界面，點擊進入進行扣款操作。
納稅申報流程:
1.從地方稅務機關官網下載“自然人稅收管理系統扣繳客戶端”軟件；在計算機上安裝。
2.輸入扣繳單位的基本信息。輸入企業代碼、認證人員(申報操作員)信息，根據提示設置登錄密碼，然後登錄軟件。進行“人員信息采集”，完成本單位員工個人基本信息的錄入。
3.可以逐個錄入信息，也可以下載導入模板，在模板中填寫後批量導入軟件。
4.收入和預扣稅的數據輸入正在進行中。壹般日常操作都是通過代扣所得稅申報單進行的，可以由員工逐個錄入，也可以批量導入。
5.申報數據錄入保存後，可以點擊“提交申報表”，選擇要提交的申報表，點擊“發送申報表”，然後點擊“下壹步，繳納稅款”，按照提示完成操作。
綜上所述，個人所得稅專項附加扣除有兩種申報方式:“通過扣繳義務人申報”和“當年綜合所得自行申報”，在個人所得稅APP上可以選擇兩種扣除方式。
法律依據:
中華人民共和國個人所得稅法
第十條
個人所得稅法第四條第壹款第三項所說的按照國家統壹規定支付的補貼、津貼，是指按照國務院規定支付的政府特殊津貼、院士津貼，以及國務院規定免繳個人所得稅的其他補貼、津貼。