如果確定是由自然災害引起的，那進項稅轉出要轉回去嗎？——不需要轉回。
只有正常虧耗的，才不做進項稅額轉出。其他的都要做進項稅額轉出。
?根據《企業會計制度》，企業存貨應定期盤點，盤虧的存貨在查明原因前，應轉入“待處理財產損益”。那麽盤虧存貨的進項稅額，是否應同時轉入“待處理財產損益”呢？《制度》沒有明確說明，而財會字〖1993〗83號文《關於增值稅會計處理的規定》規定，“企業購進的貨物、在產品、產成品發生非正常損失……，其進項稅額，應相應轉入有關科目，借記‘待處理財產損益’，……”。但在存貨盤虧尚未查明原因前，並不能確定盤虧的存貨是否屬“非正常損失”，而如果是正常損耗，其進項稅額並不需轉出，如果在盤虧時即將進項稅額全部轉出，就有可能使企業的利益受到損害。
所以有人認為，存貨在盤虧時應只將存貨的成本轉入“待處理財產損益”，至於存貨的進項稅額，待查明原因後，再確定是否轉出。當然實務中也有這樣的情況，企業盤虧資產，為了不減少賬面資產，同時也為了延遲進項稅額的轉出，將盤虧的存貨長期掛賬而不作處理，這是不符合會計制度和稅法規定的。《企業會計制度》規定，企業盤盈盤虧的資產應於期末結賬前查明原因處理完畢；稅法上，國家稅務總局第13號令《企業財產損失稅前扣除辦法》也規定，企業各項財產應在損失發生當年度申報扣除。所以企業若將盤虧資產長期掛賬而不作處理，不但違反會計制度規定，也不符合稅前扣除的要求，最終會使自己蒙受稅收利益上的損失。
目前進項稅額的轉出主要有以下幾種情況：（1）納稅人購進的貨物及在產品、產成品發生非正常損失；（2）納稅人購進的貨物或應稅勞務改變用途，如用於非應稅項目、免稅項目或集體福利與個人消費等。這兩種情況已抵扣的進項稅額之所以要轉出，是因為原購進貨物或應稅勞務不能產生增值稅銷項稅額，已抵扣的進項稅額失去了抵扣的來源。其他需要轉出進項稅額的情況有，商業企業收到供貨企業的平銷返利，出口企業按“免、抵、退”辦法計算應計入主營業務成本的不得免征和抵扣稅額等。
? 根據《增值稅條例實施細則》，“非正常損失”是指生產、經營過程中正常損耗外的損失，包括：（1）自然災害損失；（2）因管理不善造成貨物被盜竊、發生黴爛變質等損失；（3）其他非正常損失。稅法對“非正常損失”采用的是“正列舉”的方法，稅法沒有列舉的就不屬“非正常損失”。