第壹次必須親自到戶口所在地出入境管理處遞交申請。申請材料為:
居民身份證及其復印件(復印在A4紙上，可復印在同壹張紙上)，填寫《中國公民出入境證件申請表》，並拍攝2張2寸淺色背景彩色照片(也可自費現場拍照)。同時分別辦理赴港澳簽註。如果只去香港，要辦理香港簽註，如果只去澳門，要辦理澳門簽註。去港澳的話，兩個簽註都要申請。
辦理時限為受理之日起10個工作日(首次或非首次申請)。但郵寄日(壹般五天左右)和節假日不包括在內。
往來港澳通行證每張80元的費用；壹張兌換簽註，每張15元，兩張兌換簽註，每張30元。
展期合同
可以憑本人身份證和有效往來港澳通行證辦理，也可以代理辦理，代理人需攜帶本人身份證。(不同城市可能對簽有特殊規定，請咨詢戶籍所在地出入境管理處，少數城市可以郵寄續簽，如江蘇省連雲港市)。
辦理時限為自受理之日起7個工作日。
費用為每20元背書壹次；第二聯交易所簽註每張30元。
特別註意往來港澳通行證的有效期在6個月以內(部分城市為3個月)或者空白簽註頁不夠的。須按首次申請程序申請新的往來港澳通行證，同時申請簽註。
做代理人
第壹次辦理港澳通行證的，需要攜帶身份證和照片；如果不是第壹次申請，需要帶上身份證和之前的通行證。如果請人代勞，需要帶上代理人的身份證。
擴展數據:
2014年9月15日起全國公安機關出入境管理部門開始使用電子旅行證，進壹步方便內地居民往來港澳。
往來港澳通行證啟用後，往來港澳簽註不再打印為貼紙，而是直接打印在證件背面。內地、港澳口岸查驗部門不再加蓋查驗印章，簽註使用情況將由計算機信息系統記錄和管理。
成人電子往來港澳通行證有效期延長至10年，16周歲以下仍簽發5年有效通行證。電子往來港澳通行證及簽註收費維持不變。電子往來港澳通行證啟用後，仍有效的現有往來港澳通行證(本表)和往來港澳簽註(貼紙式)可繼續使用。
參考資料:
百度百科-中國人民往來港澳通行證
人民網-公安部:往來港澳電子通行證將全面啟用