不過，如果因為特殊原因錯過了退稅申請時間，比如因為生病、出差等原因，可以向稅務部門申請延期申請。稅務部門會根據具體情況進行審核，並給予壹定的寬限期。但是，這種延期申請並不常見，需要提供充分的證據和說明。
企業申請企業所得稅匯算清繳退稅的操作流程：
1、登錄國家稅務總局上海市電子稅務局，在首頁中，點擊“我要辦稅”板塊，選中“壹般退抵稅管理”。
2、找到“退抵稅費申請（匯算清繳）”，進入申請頁面正常申請即可。
3、確認原完稅情況與退稅申請情況無誤，並根據企業實際情況填寫相關欄次，最後拉至頁面最下方點擊“下壹步”。
4、請確認退稅銀行信息無誤，點擊“確認”。
5、在上報附報資料的模塊，該事項無需上傳附件資料，請直接點擊“下壹步”。
6、點擊“提交”。
7、根據實際情況，自行選擇是否短信通知；並閱讀聲明信息後，點擊“確認”。
8、業務辦理成功。
綜上所述，如果錯過了退稅申請時間，建議及時向稅務部門咨詢，了解具體的情況和解決方法。同時，也建議提前了解相關政策和規定，避免錯過重要的稅收優惠和權益。
法律依據：
《中華人民***和國稅收征收管理法》
第三條
稅收的開征、停征以及減稅、免稅、退稅、補稅，依照法律的規定執行；法律授權國務院規定的，依照國務院制定的行政法規的規定執行。