來料加工是指外商提供進口料件，即不付匯或用加工費償還進口，成品由外商銷售，經營企業收取加工費的加工貿易。
進料加工是指進口料件由經營企業進口，成品由經營企業出口的加工貿易。
(壹)加工貿易生產合同備案有關加工項目報主管部門審批後，企業應當持下列文件向企業主管海關辦理生產合同備案手續:
1.外經貿主管部門批準的加工貿易批準證書和加工企業生產能力證明；
2、企業加工合同備案報告、合同執行登記；
3.經營企業簽訂的進出口合同正本和經營企業與加工企業簽訂的加工協議(合同)正本；
4、加蓋企業印章的空白加工貿易《登記手冊》；
5、企業年檢證明，必要時還要審查經營企業、加工企業的營業執照、稅務登記證、外經貿部門批準設立企業的證明、出廠檢驗報告等。；國家對加工貿易管理實行銀行存款賬戶制度，將加工貿易進口貨物分為禁止類、限制類和允許類，將加工貿易企業分為A、B、C、d類，國家對限制類貨物加工貿易和C類企業開展的加工貿易實行銀行存款賬戶管理。銀行存款賬戶“實轉”管理的方式，壹是繳納壹筆可觀稅款的保證金，二是由中國人民銀行提供擔保。對於銀行賬戶管理的合同，海關開具《開立銀行保證金賬戶聯系單》，銀行根據海關的聯系單開具《銀行保證金賬戶通知書》。海關登記《銀行保證金賬戶通知書》編號後，發放手冊。
(二)合同的修改和延期企業執行合同的修改和延期應報主管部門批準，並向主管海關提交以下文件辦理相關手續，其中貿易性質不變、商品品種不變、合同變更金額低於654.38+00000美元(含654.38+00000美元)、延期處理期限低於3個月的合同可直接在主管海關和中國銀行辦理:
1，外貿主管部門的批準文件；
2.法人簽字、企業蓋章的合同變更和延期申請表；
3.變更與外國投資者簽訂的合同；
4、需要變更、延期的加工貿易手冊、變更、延期報告及合同執行登記；
(三)合同核銷企業加工貿易生產合同的核銷必須經主管部門批準，並向主管海關提供下列核銷單據:
1.外經貿部批準的加工貿易合同核銷申請書；
2.申請驗證登記表；
3.進出口報關單正本；
4.加工貿易《登記手冊》及其分冊；
5.國內采購的材料和零部件還應提供相關發票；加工貿易賬戶管理合同，海關打印銀行保證金賬戶核銷聯系單，銀行根據聯系單開具《銀行保證金賬戶核銷通知書》，海關根據《銀行保證金賬戶核銷通知書》辦理核銷或核銷結案手續。所有用於加工貿易的保稅進口料件均應加工復出口。如有特殊原因需內銷，必須報省級外經貿主管部門批準。(壹般貿易中實行進口配額許可證或登記管理的商品除外。未經批準，加工貿易進口的料件或制成品，由海關按《中華人民共和國海關法》和《中華人民共和國海關法行政處罰實施細則》處理。
(四)深加工結轉保稅貨物
保稅貨物深加工結轉是指加工貿易(來料加工)企業將保稅料件加工的產品結轉至另壹加工貿易企業復出口的經營活動。未經加工的保稅進口料件不得結轉。加工貿易企業開展深加工結轉業務，應事先經外貿主管部門批準，並按有關規定辦理海關手續後，方可進行實際結轉貨物。海關對保稅貨物深加工結轉實行計劃審批制。轉出企業申領《加工貿易登記手冊》(以下簡稱《登記手冊》)後，可憑《中華人民共和國海關加工貿易保稅貨物深加工結轉申請表》(以下簡稱《申請表》)向海關預申報結轉計劃。經轉關地海關同意，可以分批辦理轉關交付手續。海關對深加工結轉的保稅貨物實行轉關和非轉關兩種監管方式。未按轉關運輸結轉的，企業應當在實際交付後按照申請表內容在轉入地海關辦理報關手續；貨物按轉關運輸結轉的，每次交貨前必須分別在轉出地和轉入地海關辦理結轉海關手續。其中，批量結轉保稅貨物的處理程序為:審批？送貨？報關；壹次性辦結交付手續的，轉運地海關應當壹次性辦理報關手續。
(5)、異地加工
異地加工貿易是指加工貿易經營單位將進口料件委托給另壹關區加工生產企業的加工業務。不包括加工出口產品過程中某壹加工工序的外發加工業務。經營單位和加工企業在異地開展加工業務時，雙方應按照《中華人民共和國合同法》的規定簽訂“委托加工合同”。經營單位開展異地加工貿易，必須憑當地外貿部門出具的加工貿易批準證書和當地外貿部門出具的加工貿易加工企業生產能力證明。填寫《中華人民共和國和中國海關加工貿易異地加工申請表》，向經營單位主管海關提交異地加工申請。經營單位主管海關審核後，制作印章，交經營單位向加工企業主管海關辦理合同登記。加工企業向海關辦理合同備案手續的，須持有經營單位出具的委托書。