其壹，戶部控制的並不是國庫的全部。戶部從來沒有如今天的中央財政部門那樣統壹規劃過所有的帝國資源，其他五部都有獨立的財政自主權。
其二，明代初期，最大稅收的田賦並不征收金銀，而是征收糧食（事實上，明代任何時候都沒有以白銀作為官方標準，而是以糧食石數作為基本財政單位）。只有礦稅等稅收是金銀形式上繳，這部分銀兩不多，基本放入了內承運庫。在偶爾的情況下，田賦折合成了金銀，就送往南京作為武將的俸祿。
明代財政稅收制度設計和安排：
明代的內庫很是有名，明代中後期，因為屢屢征戰，軍事開支驟增，國庫資金收入遠遠不能應付其巨額開銷，屢有大臣上書要皇帝從內庫支取費用以供國用，但皇帝總是很不情願，寧可向人民加稅來彌補入不敷出的國庫，也不願意把自己的“私產”撥出來。這個小金庫收入不菲，又因為皇帝本人過分吝嗇，向來為史學家所詬病，以為亡國之禍。
其實明代建國伊始，只有內庫，內庫即國庫。
在正統七年，設立了戶部的太倉庫，現代正意義的國庫正式成立。太倉庫專門是用來存儲金銀，所以又叫做“銀庫”。太倉庫建立後，就有了國庫和內庫的正式區別。
明帝國財政的管理是分屬多個政府結構的，戶部只是其中之壹。財政管理制度取決於帝國的政治制度。
開支方面，其最大的特點是宮廷開支與公***資金嚴重混淆。這是明朝家國壹體化的政治制度造成的。