變更稅務登記號後，普通開票系統不需要做任何變更，之前的發票也不需要作廢。至於發票數據是否丟失，這並不重要，因為發票開出後，開票數據是在國稅網站錄入的，然後先在國稅網站核銷，與開票系統無關。
根據《稅務登記管理辦法》(國家稅務總局令第7號)第十六條規定，納稅人稅務登記內容發生變化的，取得加載統壹社會信用代碼登記證的納稅人發生變化的，生產經營場所、財務負責人、核算方式、從業人數發生變化的， 納稅人應當自實際內容發生變化之日起30日內向稅務機關申請變更，設立登記時采集的其他信息發生變化的，納稅人應當按照登記機關規定的時限向登記機關申請變更。
未領取加載統壹社會信用代碼登記證的納稅人變更稅務登記內容的，納稅人應當自登記機關辦理變更登記之日起30日內向稅務機關申請變更；
稅務登記內容發生變化，無需向登記機關辦理變更登記的，納稅人應當自實際內容發生變化之日起30日內向稅務機關申請變更。
網上變更登記操作手冊
登錄網上稅務局，點擊右側“我要辦事”中的“稅務登記”菜單，點擊“變更登記”後的【辦理】按鈕，進入辦理頁面。
註:標有*的項目為必填項。
1.輸入經理的姓名。
2.點擊〖增行〗按鈕，選擇要變更的項目，填寫變更內容。如有審批權限和批準文件，請在相應位置填寫。對於工商傳來的變更信息(具體項目見下文)，網上稅務局會自動填寫在“變更登記項目”區，不允許修改。
3.對於投資人變更(如註冊資本變更)，網上稅務局不會辦理變更，納稅人需要在家辦理變更。
4.納稅人可選擇網上變更生產經營地址、生產經營地郵政編碼等信息(具體項目見下文)。
對於跨區域變更，不應該在本模塊進行變更，而應該按照遷移註銷模塊進行處理。
稅務登記證的作用有哪些？
納稅人辦理下列事項時，必須持有稅務登記證件:
(壹)開立銀行賬戶；
(二)申請減稅、免稅、退稅；
(三)申請延期申報和延期繳納稅款；
(4)領購發票；
(五)申請簽發出國經營活動稅收管理證件；
(六)辦理停業或者歇業；
(七)其他有關稅務事項。
納稅人變更稅務登記如何辦理發票變更手續？