在規範的基礎上，沼氣站平面布置應少占土地，合理規劃，滿足工藝需要。
沼氣站應配備消防通道和小型幹粉滅火器或其他簡易滅火設備。
厭氧反應器和氣櫃應有防雷設計，防雷接地裝置的沖擊接地電阻應小於4歐姆。
遠離鐵路和其他厭氧反應器的沼氣站與相鄰建築的防火間距不應小於10m，氣櫃(低壓濕式)與相鄰建築的防火間距不應小於25m。
沼氣管道埋設時應遵循“短直、防堵、易疏通”的原則，埋設深度應在凍土層以下，管頂覆蓋厚度應符合要求。
沼氣站必須設置給排水系統，做到雨汙分流。
反應器、氣櫃、管道等鋼構件的防腐和保溫處理應符合國家現行標準。
閥門配件由雙閥控制，便於維修。
設計應遵循降低運行成本和能耗的原則。
設計取樣檢測口、溫度控制、PH檢測和H2S檢測器。