在基本農田上種樹是違法的。國家建立了基本農田保護制度，並通過《土地管理法》、《基本農田保護條例》等法律法規予以確認。《土地管理法》第三十六條規定，禁止占用基本農田發展果業、挖塘養魚。《基本農田保護條例》第17條規定，禁止任何單位和個人在基本農田保護區內建窯、建房、建墳、挖砂、采石、采礦、取土、堆放固體廢棄物或者從事其他破壞基本農田的活動。禁止任何單位和個人占用基本農田發展林果業和挖塘養魚。《土地管理法》、《基本農田保護條例》等法律法規都規定，嚴禁在基本農田種樹，但沒有規定在基本農田裏種的樹怎麽辦。雖然在基本農田植樹會對國家糧食安全產生影響，但從我國農業歷史來看，這種行為在農村早已普遍存在，既有歷史傳統，也有現實需要。實踐中，種樹壹般不會破壞耕作層，在耕地上種樹改變了土地由耕地變為林地的現狀，兩者都屬於農用地，不算改變用途。因此，法律沒有對該行為設定行政處罰。
法律依據:
《基本農田保護條例》第十七條禁止任何單位和個人建窯、建房、建墳、挖沙、采石、采礦、取土、堆放固體廢棄物或者從事其他破壞基本農田的活動。禁止任何單位和個人占用基本農田發展林果業和挖塘養魚。