1，合同糾紛訴訟時效屆滿的處理方式是:
(1)訴訟時效屆滿，債務人可以提出不履行抗辯；
(二)債務人同意履行的，不得以時效期間屆滿為由抗辯；
(3)債務人自願履行的，不得請求返還。
2.法律依據:《中華人民共和國民法典》第192條
如果訴訟時效屆滿，債務人可以提出不履行的抗辯。
訴訟時效期間屆滿後，債務人同意履行的，不得以訴訟時效期間屆滿為由抗辯；債務人自願履行的，不得請求返還。
第188條
向人民法院請求保護民事權利的時效期間為三年。法律另有規定的，從其規定。
訴訟時效期間從債權人知道或者應當知道權利受到損害和債務人知道之日起計算。法律另有規定的，從其規定。但是，自權利被損害之日起超過二十年的，人民法院不予保護。特殊情況下，人民法院根據權利人的申請，可以決定延期。
二、合同違約的訴訟流程是怎樣的？
對於違約，壹般訴訟程序如下:
1.壹方寫起訴狀，向人民法院提起訴訟；
2、人民法院受理後，如果符合起訴條件，作出立案決定；
3.人民法院將起訴狀副本送達被告；
4.在開庭三日前通知當事人；
5.參與試驗。