第壹，婚姻登記程序不同:
軍人結婚需要軍隊的批準。普通婚姻只要男女雙方未婚，達到法定結婚年齡，就可以結婚。
中國人民解放軍總政治部1980 12.29發布《軍隊執行中華人民共和國婚姻法暫行規定》，規定軍人要求結婚，必須先經軍隊審查批準，其出生日期、民族、婚姻狀況必須經所在單位政治機關證明。然後就可以去當地的婚姻登記處辦理結婚登記了。
第二，離婚程序不同:
普通婚姻離婚只要男女之間沒有相關糾紛就可以協商，而軍婚離婚如果軍人不同意就由法院判決，除非夫妻關系無法維持。
《婚姻法》第二十六條規定:“現役軍人的配偶要求離婚的，必須征得現役軍人的同意。”
現役軍人提出離婚的，或者雙方都是現役軍人的，依照婚姻法第二十五條的規定辦理。
第三，婚假不同:
普通婚姻:按照法定結婚年齡，男滿22周歲，女滿20周歲的，享受婚假3天；符合晚婚年齡，男25周歲，女23周歲的，可享受15天婚假(含法定婚假3天)。
軍婚:除國家規定的婚假外，晚婚的軍人可享受7天婚假，即最多22天婚假。
參考資料:
百度百科-軍婚