1，公訴案件證據不足，不能認定被告人有罪的，因證據不足，指控的罪名不能成立，法院應當作出無罪判決；對於缺乏刑事證據的自訴案件，自訴人不能提供補充證據的，法院應當說服自訴人撤回自訴或者裁定駁回。
2.自訴人經依法傳喚兩次，無正當理由拒不到庭的，或者未經法庭許可中途退庭的，按撤訴處理。；對於簡單的刑事起訴案件，檢察機關可以不派員出庭支持公訴。
3.自訴案件法院可以調解；宣判前，自訴人也可以與被告人和解或者撤回自訴；公訴案件不適用調解。
4.自訴案件的被告人可以在訴訟過程中對自訴人提起反訴；同壹條款不適用於公訴案件。
5.對被告知後才處理的案件，以及被害人有證據證明的輕微刑事案件，人民法院可以進行調解。調解應當建立在查明事實、分清是非的基礎上。調解應當堅持自願、合法的原則，調解不得損害國家、集體和其他公民的利益。法院調解是人民法院行使國家司法權的壹種方式。人民法院通過調解結案，有利於及時解決輕微刑事案件，防止矛盾激化，提高訴訟效率。自訴案件經調解解決的，應當制作調解書。調解書壹經送達，即發生法律效力。調解書送達前，調解不成或者壹方反悔的，人民法院應當作出判決。
6.宣判前，自訴人可以與被告人和解，也可以撤回自訴，這是雙方行使訴訟權利的行為。當事人自願達成和解協議或者自訴人申請撤訴的案件，人民法院應當審查，確屬自願合法，不損害國家、社會和其他公民利益的，應當準許。這是公訴案件做不到的。
7.至於刑事訴訟法第170條第(三)項規定的案件能否提起反訴，刑事訴訟法沒有特別限制。但在司法實踐中，由於此類案件被“轉為”自訴案件，大多性質嚴重、情節復雜、涉及面廣、審理難度大。另外兩類自訴案件規模要大得多。因此，第(1)項沒有對反訴進行壹定的限制，增加了審判的難度，可能會影響案件的質量。
8.對於不適用簡易程序的自訴案件，第壹審審判程序與公訴案件第壹審普通程序基本相同，可以參照公訴案件第壹審普通程序的規定執行。