船舶國籍發生正面沖突時，法律適用有幾種意見:(1)船舶所有人意誌說。有人認為，船舶的國籍並不總是與公共福利有關，應充分尊重當事人的意思。但其缺陷也是顯而易見的:船舶的國籍可以根據船東的意願隨意變更；當國內外發生正面沖突時，國內的公共福利就會被忽略。(2)旗法理論。主張從客觀價值考察，應將目前正在懸掛的國旗所代表的國家的法律視為國旗法。這種主張可以保護第三人的利益，但存在流轉說的缺陷，容易將船舶的國籍與船旗混淆，本質上類似於船舶所有人的意思說。(3)自然人國籍的類比。主張用類推的方法解決自然人的國籍沖突，即當國內船舶與外國船舶發生國籍沖突時，國內船舶的國籍優先；外國船舶發生國籍沖突時，按照最密切聯系原則確定。這個命題更有針對性和合理性。船舶國籍的消極沖突是指船舶不具有任何國家的國籍，也稱為無國籍現象。船舶國籍的消極沖突或無國籍狀態主要有三種:壹是船舶已經建造，尚未根據壹國國內法取得國籍；二是船舶取得的國籍無效或被撤銷；第三，船舶根據國籍國國內法喪失國籍，沒有恢復國籍。
船舶國籍發生消極沖突時，法律適用有幾種意見:(1)自然人國籍的類推。主張適用船籍港所在地法，就像解決自然人國籍的消極沖突壹樣。這個命題有壹定的合理性。(2)分級應用理論。主張首先應遵循船籍港所在地的法律；船籍港不明的，適用船舶所在地法律；當船舶在公海上時，應適用法院地的法律。這種做法客觀公正，符合最密切聯系原則的要求。(3)區分理論。主張如果船舶因船舶所有人消極的國籍沖突而成為無國籍人，應共同適用自然人國籍沖突的解決辦法；對於其他負面沖突，各國應盡量避免；在船舶獲得新國籍之前，不允許失去舊國籍。這個命題有壹定的針對性，但也有例外。如果船舶未收到船舶國籍證書，則應獨立適用將收到該證書的國家的國內法。