公司依法清算後，方可向公司登記機關申請註銷登記。因此，公司在訴訟時，權利義務關系不明確，公司清算組無法準確確定公司資產和債權債務，暫時無法撤銷。具體原因如下:
1.公司所涉債權債務關系尚在法院訴訟期間，若公司註銷登記，不能保證涉案債權債務關系得到妥善清算和處理；
2.公司還在法院訴訟時，如果公司註銷登記，債權人不能依法及時參與債權分配，直接導致債權人權益難以實現；
3.此外，由於公司在訴訟過程中被註銷，失去了獨立的法律人格，即不能作為法定訴訟主體參與訴訟，因此將面臨訴訟主體變更的問題。此時，公司原有股東可能被追加為案件當事人，甚至最終承擔相應的股東責任。
訴訟過程中處理公司註銷有幾種方式:
1.在訴訟過程中，企業註銷，法院在變更訴訟主體後，如將個體工商戶變更為實際經營者，將法人變更為股東、發起人、董事、實際控制人等，將繼續依法審理和判決。
2.在訴訟過程中，企業被註銷，民事主體資格已經消滅。法院以當事人不合格，不符合起訴條件為由，直接駁回起訴；
3.法院二審認定壹審撤銷企業的事實尚未查清的，以事實錯誤或者不清為由發回重審，或者直接變更訴訟主體後改判；
4.法院組織雙方和解，然後雙方以和解為由向法院撤訴，法院以撤訴裁定結案。
綜上所述，公司在訴訟過程中註銷登記是不妥當的，不利於債權人權益的保護，也影響了公司的合理清算和股東有限責任的承擔。依法對公司進行合理清算，徹底處理好公司的債權債務，再進行註銷登記，是公司退市的最佳方式。
法律依據:
《中華人民共和國公司法》第186條
清算組在清理公司財產、編制資產負債表和財產清單後，應當制定清算方案，並報股東會、股東大會或者人民法院確認。
公司財產在支付清算費用、職工工資、社會保險費用和法定賠償、繳納所欠稅款、清償公司債務後，按照有限責任公司股東的出資比例和股份有限公司股東的股份比例進行分配。
清算期間，公司存續，但不得開展與清算無關的經營活動。公司財產在依照前款規定清償前，不得分配給股東。