1，內容不同:
(1)員工手冊主要是企業內部人事制度的管理規範，同時涵蓋了企業的方方面面，承擔著傳播企業形象和企業文化的功能。它是有效的管理工具，也是員工的行動指南。
(2)規章制度主要包括:勞動合同管理、薪酬管理、社會保險待遇、工作時間休假、員工獎懲、其他勞動管理規定。
2、功能不同:
(1)《員工手冊》是企業規章制度、企業文化、企業戰略的凝結，是企業內部的“法規”，也起到展示企業形象、傳播企業文化的作用。
(2)制定企業規章制度是建立現代企業制度的需要。制定企業規章制度是規範和指導企業部門工作和員工行為的需要。企業規章制度是完善“勞動合同制度”和解決勞動爭議不可或缺的有力手段。
3、寫作原則(程序)不同:
(1)在編制員工手冊的過程中，應遵循五項原則:依法辦事、權責對等、實事求是、持續改進、公平、公正、公開。
①依法辦事:根據國家法律、法規和行政規章制定員工手冊。
②權責對等:員工手冊應充分體現企業與員工的平等關系，權利義務對等。
(3)要實用:員工手冊要有實用的內容，體現企業的個性特征。
④持續改進:員工手冊應及時、持續改進和完善。
⑤公平、公正、公開:員工是企業的壹員，企業的發展離不開全體員工的參與，所以要廣泛征求大家的意見，積極采納好的意見和建議。
(2)規章制度的制定或重大問題的決定，應當經職工代表大會或全體職工討論，提出建議和意見，與工會或職工代表平等協商確定。
因此，這個程序分為兩個步驟:
(1)第壹步是由職工代表大會或全體職工討論，提出方案和意見；
(2)第二步，與工會或職工代表平等協商。壹般來說，企業已經建立工會的，應當與企業工會協商確定；沒有工會的，應當與職工代表協商確定。這個程序可以說是“先民主，後集權”。
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