首先，兩者的含義不同:
1，二級建造師的意義:二級建造師是建築學專業資格，是做項目經理的必備條件。註冊建造師是以專業技術為依托，以項目管理為核心的註冊執業人員。
通過二級建造師資格考試的，由省、自治區、直轄市人事廳、住建廳授予《中華人民共和國二級建造師資格證書》。取得建造師執業資格證書並註冊後，取得二級建造師註冊證書，可聘用註冊建造師執業。
2.二級註冊建築師的含義:二級註冊建築師是指通過全國統壹考試，取得國家二級註冊建築師資格證書，依法註冊，取得中國二級註冊建築師證書，在壹個建設單位開展註冊建築師業務的人員。
取得國家二級註冊建築師資格證書的人員，經有關部門註冊後，方可稱為國家二級註冊建築師。
二、報名條件不同:
1，二級建造師報名條件，遵紀守法，符合下列條件之壹者，可報名參加二級建造師所有科目考試:
(1)具有工程類或工程經濟類專業中專以上學歷，從事建設項目施工和管理工作滿兩年。
(2)具有其他專業中專以上學歷並從事建設項目施工管理工作滿5年。
(3)從事建設工程施工及管理工作滿15年。
2.二級註冊建築師註冊條件。首次參加二級註冊建築師資格考試的報考者，必須符合下列條件之壹:
(1)專業、學歷、工作時間按本條附件3的要求執行。
(2)具有助理建築師、助理工程師等專業技術職稱並從事建築設計或相關業務3年以上(含3年)的人員，均可報考。
(3)不具備本條附件3規定的學歷的申請人，應累計從事工程設計工作13年，並應符合下列條件之壹。作為項目負責人或專業負責人，應完成4項4級及以上民用建築設計項目的全過程設計，其中至少完成1項3級及以上項目。
作為項目負責人或專業負責人，完成4項其他類型建築設計小型及以上項目的全過程設計，其中至少1項中型項目。
三、兩種考試科目不同:
1.二級建造師考試科目:二級建造師資格考試由建築工程施工管理、建築工程法規及相關知識、專業工程管理與實務三個科目組成。
其中，“專業工程管理與實務”科目分為建築工程、公路工程、水利水電工程、市政工程、采礦工程、機電工程六個專業類別。考生可在報名時根據實際工作需要選擇壹個。
2.二級註冊建築師考試科目:建築結構與詳圖(制圖題)、法律法規、經濟與施工、建築結構與設備、場地與建築設計(制圖題)。
百度百科-二級構建器
百度百科-二級註冊建築師