殘聯補貼的申請流程如下:
1.向戶籍所在地鄉鎮殘聯、民政窗口提出書面申請，進行初審，壹般在10個工作日內；
2.初審通過後，縣級殘聯將轉介至縣級民政部門對申請人的家庭經濟狀況進行核對和審核，也是在10個工作日內；
3.縣級民政部門審核後，配合縣級財政部門申請將補助資金撥付到個人賬戶。壹、二級殘疾人不用交新農合，但要全額繳納。三四級殘疾人如果是低保戶貧困戶就不用交，否則就要交。
法律依據:
《中華人民共和國殘疾人保障法》
第四十八條各級人民政府通過多種渠道為生活確有困難的殘疾人提供生活、教育、住房等社會救助。
縣級以上地方人民政府應當采取其他措施，保障享受最低生活保障待遇後仍有特殊困難的殘疾人家庭的基本生活。
各級人民政府應當對貧困殘疾人在基本醫療、康復服務以及必要輔助器具的配置和更換等方面給予幫助。
地方各級人民政府應當對生活不能自理的殘疾人給予護理補貼。
中國殘疾人聯合會、國家衛生計生委關於印發《中華人民共和國殘疾人證管理辦法》的通知
第九條殘疾人證的發放程序。
(1)申請:首次申領殘疾人證的申請人，須向戶籍所在地縣級殘聯出示申請人的居民身份證、戶口本和近期二寸免冠白底照片三張，如實填寫申請表和評估表。申請智力和精神殘疾證和未成年人申請殘疾證，必須同時提供法定監護人的證明材料。有條件的地方可以網上申請。
(二)受理:縣級殘聯收到申請人提交的申請材料後，對申請人、法定監護人、照片、身份證、戶口簿進行確認，填寫虛假信息者不予受理。
(3)評定:由指定機構對申領《殘疾人證》的申請人進行殘疾評定，根據殘疾標準對殘疾類別和等級做出明確結論，填寫評定表並加蓋公章。評定結論符合殘疾標準的，在申請人所在村(社區)進行公示，公示時間為五個工作日；申請人為未成年人的，原則上不予公示。
(四)審批:縣級殘聯對申請材料、受理程序、殘疾評定結論和公示結果進行審查，十個工作日內完成審查。
經審核符合規定的，予以批準，填寫並打印《殘疾人證》相關信息，並在批準的殘疾人聯合會壹欄加蓋公章，在持證人頭像上加蓋鋼印，並將《殘疾評定表》等相關信息錄入殘疾人人口基礎數據庫。
鑒定結論不符合傷殘標準的，不予辦理。
(五)發放和存檔:縣級殘聯向申請人發放殘疾人證，並將申請表、測評表、公示結果等相關材料存檔，長期保存。
第十條有條件的地方，可以將殘疾人證申請的受理和發放工作委托給鄉鎮(街道)殘疾人聯合會。
第十壹條有條件的地方應當開展殘疾評估鑒定服務。