通過個人所得稅制度的產生和發展，借鑒美國等發達國家成熟的個人所得稅制度，我國個人所得稅制度的合理構建必須遵循國情循序漸進，堅持低稅負、有效運行的原則，從以下幾個方面科學設計具體制度。
(壹)繼續逐步從分類所得稅制向綜合所得稅制過渡。
借鑒美國和世界的通行做法，我國個人所得稅制度應繼續由分類制向綜合制轉變。將按分項按月納稅改為按年收入綜合納稅。當然，我國的征管體制和水平還沒有完全具備應對這種變化的條件，可以等待時機，逐步達到目標。
(二)建立合理的稅率結構
首先，將現行兩套稅率統壹為超額累進稅率，以平衡納稅人。其次，為了簡化稅制，應該降低累進稅率的檔次，可以考慮將九檔降為三到五檔。再次，在條件成熟時，根據納稅人的家庭和婚姻狀況設計不同的累進稅率，鼓勵納稅人以家庭為單位進行納稅計算和申報。
(3)規範扣除範圍和標準。
首先，收入支付的必要費用要按照純收益原則扣除。其次，納稅人發生的特殊費用，如醫療費、意外損失等，應允許實事求是地扣除。再次，在確定個人生計費用扣除時，需要考慮納稅人的婚姻、家庭照顧人口等情況給予個人免征額和扣除額。
(四)擴大納稅人的知情權，增強納稅人的納稅意識。
擴大納稅人的知情權，增加政府預算和支出的透明度，不僅可以使稅收征收過程清晰，而且可以使稅收流向明確，可以有效消除納稅人的納稅阻力，增強監督意識，有助於遏制腐敗。
(五)加大對偷逃個人所得稅行為的查處力度，維護法律的嚴肅性。
全國每年要開展幾次個人所得稅專項檢查，加強稅務機關與相關部門的密切配合；通過立法，賦予稅務機關壹些特殊權力，加強執法力度；加大對納稅人的罰款力度，參考壹些國家的做法——納稅人無論偷了多少稅，都要被罰得血本無歸，其偷稅行為也要公之於眾，以儆效尤，督促其他納稅人依法納稅。同時，對壹些偷稅構成犯罪的納稅人，不能以罰代法，必須依法追究其刑事責任，維護法律的嚴肅性。
(六)提高稅收征管信息化水平，完善稅收征管配套措施。
目前，在中國，個人收入分配是多樣化的、隱蔽的，支付方式是現金。我們采取美國等壹些發達國家的做法，建立個人所得稅檔案，為每個納稅人建立壹個稅號。同時，盡快建立個人財產登記制度，繼續完善儲蓄存款實名制登記制度，實行居民身份證號碼和納稅人號終身固定制，發展計算機網絡，嚴格辦理身份證。所有的個人收入和支出都是在稅專號下進行的。加強稅務、工商、銀行、海關的個人收支信息聯網，增加個人收入的透明度，使公民的每壹筆收入都處於稅務機關的有效監控之下，以堵塞稅收漏洞，防止稅收流失。