1.企業合並中發生的直接相關費用。同壹控制下企業合並發生的直接相關費用計入當期損益(管理費用)。非同壹控制下企業合並中發生的直接相關費用計入當期損益(管理費用)。
2.在企業合並以外的其他方式中，發生的直接相關費用計入投資成本。
二、審計費、咨詢費、評估費等間接費用計入管理費用。
3.發行債券及權益性證券作為合並對價之手續費及傭金處理。
1.發行債券進行企業合並的，與發行債券相關的傭金和手續費計入負債的初始確認金額。
2.以權益性證券(股票)作為合並對價發行的，與發行的權益性證券相關的傭金和手續費，無論是否與企業合並直接相關，均從發行的權益性證券發行收入中扣除，發行權益性工具有溢價的，從溢價收入中扣除。權益性證券發行無溢價或溢價不足抵扣的，沖減盈余公積和未分配利潤。
權益類證券與債務類證券的區別主要表現在以下七個方面:
1.投資者對發行人有不同的權利。對於投資和權益類證券，投資者將成為發行人的股東，有權將其身份信息錄入股東名冊，通過投票參與企業的生產經營決策，享有被選舉權和分享分紅權，但投資者投入的資金不得收回。
對於投資和債務證券，投資者將成為發行人的債權人，有權要求發行人按合同約定支付本息，但壹般不允許參與發行公司的生產經營決策。
2.投資者通過不同的方式獲得收益。投資者投資權益類債券壹般可以通過兩種方式獲得收益，壹種是給企業分紅，另壹種是低價買入權益類債券，高價賣出，賺取資本利得(小股東比較常見)。投資和債務證券主要賺取利息收入。
3.投資者要求的必要收益率是不壹樣的。對於投資和債務證券，主要風險是發行人違約風險，企業生產經營產生的利潤優先支付債務利息；投資和股權證券應承擔發行人的經營風險和財務風險。根據風險和收益相等的原則，債務證券投資者要求的收益率低於權益證券投資者。
4.發行人的資金成本不同。從發行人的角度來看，投資者要求的回報是發行人付出的資本成本，股權融資的資本成本高於債權融資。
5.對發行人控制權的不同影響。發行權益性證券時，所有者權益會增加，流通股數增加，容易分散公司的控制權。債務證券的發行將形成發行公司的負債，不影響公司的控制權。
6.對發行人資本結構的影響不同。權益類證券的發行形成了公司穩定的資本基礎，增加了所有者權益，降低了負債與所有者權益的比率，減輕了企業的償債壓力，降低了財務杠桿，資本結構更加穩定；發行債務證券增加了負債、財務杠桿和償債壓力。
7.發行成本不同。壹般情況下，權益類債券的發行成本高於債券類證券。