永昌元年，唐高宗駕崩，武則天以皇後的身份登上王位，並自稱“聖靈皇帝”。正是在這種復雜的政治背景下，徐有功入主四興寺。唐朝很多舊臣和李氏貴族都非常反對武則天稱帝，有的甚至反對武則天。如(684)在揚州起義，唐朝宗室、李真(688)起兵反吳等等。武則天自然對這些舊臣和唐朝貴族恨之入骨，壹次次派兵鎮壓。面對這種嚴峻的政治形勢，武則天為了鞏固自己的統治地位，任用殘暴的官員，誣建監獄，背離法律法規，先後處決所謂違法的唐朝舊臣和宗室貴族，以威懾潛在的敵對勢力，達到自己的政治目的。她要對抗敵對勢力，必須有壹批酷吏作為幫手，所以她選擇的酷吏也是“不拘壹格”，比如著名的酷吏賴君臣、周興。他們中的壹些人曾經是不認識壹筐字的街頭流氓，靠指責人起家。在這種政治氣候下，徐有功受到了懲罰。如果他能像賴君臣、周興那樣，巴結殘暴的官員，背離國法，按照武則天的意圖判案。有了他的奇才，高官厚祿自然指日可待。但徐有功不是這樣的人，而是堅決執法，堂堂正正，冒著生命危險維護法律的嚴肅性，制止各種冤假錯案的泛濫。比如他和武則天的第壹次沖突:為了及時、廣泛地掌握“敵情”，武則天在全國各地設立了舉報人，也就是她還在朝廷設立了舉報箱。凡能舉報重大叛亂者，可重賞。於是，國民譴責之風急劇上升。
這壹年，有壹個叫馮景通的人，把他和李崇同密謀的事告訴了韋州桂香縣令顏，李崇同去年被殺。武則天立即召酷吏、殿中欽差大臣賴君臣來聽案。顏在長安被捕後，賴君臣立即提審此案，迫使顏承認是謀反，顏大呼冤。嚴刑拷打之後，顏無奈認罪，寫了壹份供狀:從供狀上看，顏和只能說是壹般關系，和謀反聯系不上。賴君臣知道聖靈帝需要什麽。為了邀功，他用盡各種刑具，不擇手段地向顏逼供。顏不忍骨肉之痛，最後不得不在供狀上寫下“與李崇同謀反”四個字。賴君臣見嚴認罪，奏告武則天。武則天看了“供詞”後，要求賴君臣將此案移送四興寺正式宣判。過去朝廷移交給朝廷的案件，幾乎都是按照朝廷的判決。這壹次，顏的案子由壹個新的罪犯，程處理。徐有功仔細閱讀了文件。他覺得雖然顏承認了，但是“勾結李崇同”的證據不足。然而，徐有功清楚地知道懺悔的優點——重罰會產生鬼魂。和顏沒有任何關系。是法律的公正、公平、無私驅使他去尋找真相。他思考的是如何糾正已經成立的冤案或者縮小對法律的背離，減輕嚴的罪名。他查閱了當年武則天簽發的永昌假釋，發現了“教主”“擁黨”等字樣。他笑了，“我為什麽不這樣做？”於是他在審理顏案時，引用《永昌假釋》判顏為謀反案的“黨羽”，流放三千裏，免除顏死刑。這種“支持壹方”的裁決不僅惹惱了賴君臣，也讓其他幾個狠心的官員不滿。另壹個殘酷的官員，魏袁鐘，直接扮演武則天，並要求燕是叛亂的領導者，沒有家庭背景。武則天必須演奏下壹首曲子。在古代，皇帝的聖旨是最高的、最終的判決，所有人都得遵從。然而，徐有功依靠的是他的執著——執法應該公正守法；法律是國家的生命，是行動的準則；法不正，國家就亂了，要硬著頭皮向武則天強烈抗議。第二天，當他去法院，是第壹個走出課堂，發揮皇帝的聖靈:“請考慮的情況下，燕余慶，並作出最後決定。顏與有關系，如為非法收私債、寫信等。然而，在陛下發布的永昌赦免令中，李沖和最高領導人李真被指控為邪惡。可以看出，李沖叛亂案的最高領導人已經被繩之以法。根據顏的供述，那只是壹個漏網的黨支部。因此，根據赦免令，他應該免於死罪，判處流放。如果原諒了又回到罪上，還不如不原諒，如何面對這個世界？我們神聖的法庭絕不能這樣行事。”
武則天見壹個穿著六品禦服的小官許竟敢反駁她的詔書，而且當著眾官的面，暗示她沒有違背永昌大赦令，就生氣地問:“照妳的說法，狀元算什麽？”徐有功平靜地回答:“首先是原計劃。”武則天又生氣地問:“燕余慶不是狀元嗎？”徐有功回答說:“如果他是最高領導人，他在李沖被殺時就應該被繩之以法。直到被赦免後，他才意識到自己只是在支持黨。”武則天的聲音越來越粗:“他替李沖收私債，買弓箭算什麽？”徐有功答道:“討債是事實，但買弓箭與顏余慶無關。”武則天生氣地問:“二月討債，八月著書，還能當幫兇嗎？”徐有功平靜地說:“我們溝通的信件不是被查封的，而只是基於口供，而口供只承認那是與李沖的禮節性問候。而且討債和圖書流通只能歸於擁黨行為，並不等於共犯頭目！”法庭上的辯論讓在場的文武大臣嚇得臉色發青。清官擔心徐有功的前途和生命安全，而徐有功則“無所畏懼，有理有據”。他以壹種從容的風度，像小溪壹樣回答，沒有任何膽怯和恐懼。武則天壹開始怒不可遏。後來，她漸漸覺得這位名叫“許”的官員有著普通官員所沒有的勇氣和見識。自從她掌權以來，這是我第壹次見到敢和她爭論的官員，尤其是在謀反的情況下。她同意殺人，沒有人和她爭論過。其實武則天很有政治頭腦，也很愛惜人才，她的怒氣也慢慢平息了。她對徐有功說:“燕到底是不是黨？卿必去細問，奏之。”
法庭上的數百名文武官員似乎在這場爭論中看到了壹場驚心動魄的刀光劍影。然而，令他們驚訝的是，武則天終於找到了壹個臺階，並走了下來，要求徐有功重新審查燕余慶是否支持黨。可見徐有功已經允許強諫，他們為徐有功長舒了壹口氣。回朝鮮後，徐有功又審嚴，以“撐黨”的罪名打武則天，最終得到武則天的批準。在和武侯的激烈爭論中，顏終於從死神那裏重新獲得了生命的希望。他被免了死刑，改成了遠流，家人也免了官奴。這是徐有功維護法律尊嚴和正義，制止權力大於法律的冤假錯案的第壹戰。當然也是首戰告捷。徐有功在四興寺工作了三年，其間糾正了數百起冤假錯案，挽救了數千人的生命。服役三年後，他被調到秋官(前稱懲罰部)，在秋官擔任外交部長，後來在秋官晉升為醫生(從五年級開始)。他負責審查四星寺的判決，並能夠參與重大案件的審理。徐有功到秋官後不久，有壹天，他的頂頭上司周興(也是武則天時期著名的殘暴官員)交給他壹份案卷，說:“此案是道州舊唐宗室兄弟李仁寶謀反案，四興寺已判叛國罪。請妳看壹看……”徐有功接過案卷，仔細閱讀。他看完之後對周興說:“兄弟兩個練武超過箭怎麽能算叛國謀反呢？這不算太錯，應該馬上改正！”周興冷冷壹笑:“李仁寶兄弟都是舊唐李氏家族的人。妳知道聖皇最討厭誰嗎？無論是練武還是比武，今天刀槍廝殺，明天就要帶兵造反。判他們叛國罪有什麽錯？不殺他們妳殺誰？”徐有功大叫道:“與箭相比，練武術能推斷出謀反罪嗎？哪裏有正義，哪裏有國法，皇帝可以不講事實嗎？!"兩人爭執起來。
其實周興和賴君臣等人是不壹樣的。他出身秀才，褻瀆了許多法書，是個善於“鍛煉”而身陷囹圄的人。他打壓徐有功為秋官侍郎，寫了壹封誣告徐有功的信，由武則天扮演。說徐有功有某種政治動機。“所以，出獄的兄弟李仁寶是有罪的。”又說:“中國法律，不重視就要砍頭，欺負妳的也要砍頭。”古代經書上有壹句話:犯法者被殺。徐有功打算保護叛徒，這是死罪。請把徐有功關進監獄接受調查。"
武則天對徐有功有壹種欣賞——他忠厚守法，才華橫溢；但她又討厭他了——他經常出來和她爭論，妨礙了她消除敵對勢力。她對徐有功的態度介於兩者之間。聽說周星說要殺了他，但是還沒有打算。於是他寫了壹封信:“禁止逮捕和審問徐有功，罷免他的官職，降級人民。”徐有功和武則天這次甚至沒有機會當面爭辯。接到家裏的命令後，他被撤職了。然而，武則天仍然對徐有功另眼相看。如果落到周興手裏。不判自己死刑，就打死。
周興為了人民的利益解雇徐有功並沒有就此停止。他派出許多“眼睛”窺探的壹舉壹動，尤其註意唐朝李氏家族與舊臣有無往來。如果徐有功不小心，他也會被誣告陰謀反對他的同誌，並被判處死刑。從上壹個例子中，我們可以看到徐有功很難保護法律。有武侯的欺軟怕硬，有酷吏的羅網和誣告。這個時候，執法難，維護法律的正義性和嚴肅性是多麽困難啊！徐有功被罷黜後不到半年，周興也被指控“謀反”，受到了賴君臣的審判。賴君臣以“請入甕”要挾周興，承認謀反之罪。周興受盡折磨卻不得不認罪，但武則天不同意將“效忠”多年的周興斬首。反而被流放，但在流放途中也被仇人殺死。周興的死釋放了壹雙監視徐有功的眼睛。周長壽二年(693)，武則天重用徐有功，任命他為左肅的政治顧問(從六年級起)。徐有功無法拒絕，所以他不得不上任。徐有功被任命為禦史後，潤州發生了壹起龐氏騙局。龐氏原本是竇德妃的母親，唐睿宗李旦的嶽母，潤州刺史竇的妻子。自從女兒德公主被武則天殺死後，她就壹直心神不定，郁郁寡歡，以為自己被鬼附身了。她聽了壹個奴才的話，晚上燒香祈福驅魔。但是這個燒香驅鬼的事情被人舉報了，說她每晚燒香，詛咒武則天早死。武則天殺了德妃後找不到親人的“謀反”把柄和不軌行為。殘暴的官員薛繼昌為了迎合武侯的意願，編造了龐氏這個“不道德”的罪名。龐氏被判死刑時，家人被流放三千裏。
當徐有功得知後，他也知道這是武侯的遺囑，很難撤銷。但是他想:漠視人命的國法怎麽能這樣生存下去呢？我應該以謀士的身份向皇帝進諫，權力大於法律的現象不能繼續下去。即使我死了，我也要保護法律！於是他直奔皇宮，對武則天說:“陛下，根據我的探訪，龐夫人是無辜的。殺壹個無辜的人，不僅讓全世界發笑，還關系到唐朝的法律法規。請三思。”當武則天聽到徐有功為她心腹的母親龐氏辯護時，她非常生氣。站在她身旁的薛繼昌趁機說:“萬歲！根據法律，任何為罪人狡辯辯護的人也應該被斬首。徐有功為死囚辯護。他對皇帝毫無敬意，應該以“助紂為虐”定罪，應該立即斬首。薛繼昌的話無疑給武則天的憤怒火上澆油，於是她立即下令:“將徐有功轟出皇宮，懲罰四星殿。“四星寺很快就同意了徐有功的“黨同伐異”罪，判處他死刑。徐有功有壹個好朋友，所以他悄悄地跑到他家告訴徐有功這個消息，並流著淚告訴他要早做準備。徐有功坦率地說，“別哭了。只有我會死嗎？"?我捍衛國家的法律，為法律說句公道話，權力不能大於法律！我為執法和保護法律而死。死了多可惜啊！”他漫不經心地陪朋友吃飯，打了個盹。下午，他被刀斧手綁著帶到了刑場。
徐有功被送上刑場的消息在北京引起了轟動。經過老臣們的仗義執言，武則天終於下令:“將徐有功免於極刑，革職流放邊疆。”龐茲因此免於死刑，被判了遠流。徐有功再壹次用死亡捍衛了法律，阻止了另壹起死刑案件。真是感人肺腑，感人肺腑。武則天當政時，徐有功先後擔任過周浦司法參軍(地方司法官)、左肅禦史、四府邵青(大理寺司法官)。當時酷吏驕橫，誣陷無辜，嚴刑峻法，朝野都嚇壞了，不敢自圓其說。徐有功，獨自壹人，被免職三次，但他決心拯救幾十個家庭。有壹次，亳州刺史因壹樁罪行受到懲罰，這件事牽涉到壹個叫嚴的官員。武則天命令壹名殘暴的官員來到法庭審理此案，後者指控嚴余慶犯有叛亂罪。在朝廷上，當賴君臣向武則天匯報時，謀士魏也認為嚴應該判死刑，武則天下旨批準了。堅持認為顏不是“頭號人物”，不能任其宰割。武則天大怒，問:“什麽是狀元？”徐有功說:“勝利者是領導者；第壹個是元謀。”後來，武則天免除了嚴的死刑。有壹個叫韓的人，在起義時接受了壹個假官職。朝廷審理謀反案時，韓已經死了，但負責審理的顧仲淹要求賠韓財物，武則天認可。徐有功抗議道:“壹個人死了，就不應該追究他的罪行，更不要牽連別人。”後來有幾十個人因為這個案子被原諒了。徐有功曾對他的親人說:“作為大理人，生命危在旦夕，切不可為了躲避而聽從指示和詭辯。”當時告密者通常采用誘導別人的奴婢告主人的方法，以獲得政府的獎賞。潤州刺史竇的妻子龐氏被奴婢誣告，監察禦史薛繼昌認為龐氏應該被判死刑。他的兒子去徐有功打官司，徐有功壹邊打武則天，壹邊發公文制止處罰。薛其昌非常生氣。他彈劾徐有功枉法，他應該被處死。徐有功說:“難道我壹個人死了，所有的人都不會死嗎？”武則天召見他，問他:“妳輸得比破獄還多。為什麽？”徐有功回答:“失去了，就太小了；好生是聖人之德。”武則天知道徐有功是壹個忠臣，所以免除了她的龐氏死罪。
天授元年(公元690年)，道州刺史李仁寶兄弟被酷吏陷害。盡管徐有功堅持為保護法律而戰，但他失敗了，並被免職。不久，他被重用為顧問。“世人皆聞其大有進步，可喜可賀。”徐有功依照法律審理了這個案件，盡管他從未動過。他因三次守法而受委屈，但“他必死，他不憂；原諒它不喜歡它。”武則天因此非常看重他。當時，人們稱贊徐有功“只聽清楚訴訟，只平平地維護法律”。
關於徐有功的正直和守法有很多例子。在約15年的司法任期內，他三次被控死罪(其中壹次改為流放)，但他都很冷靜，無動於衷。吳映潔的忠誠和勇氣打動了澤天(她將被召回流放到徐有功的壹座刑殿任職)。他當法官前後，辦了六七百件大案，救了幾萬人。他既不自私，也不為君主的私欲所左右。他遵守世界的法則，無私地閱讀它。正因為他是壹個清正廉明的官員，才能在各種誣告中傲然挺立，以至於那些頻頻彈劾、推波助瀾的殘酷官員，都找不出他和罪犯有什麽特殊的關系。正義、忠誠、無私、才華和勇氣是徐有功成為古代最好的法官的主要原因，因此他受到了歷代人們的支持和愛戴。