協助局領導處理機關日常事務；組織起草相關重要文稿；負責組織重要會議；負責領導批示、會議決定等重要事項的督辦；負責信息、文秘、檔案、保密、信訪、接待和聯絡工作；負責議案、建議和提案；負責行政、後勤、安全、財務及各種費用和資金的管理；承辦機關及直屬單位人員出國(境)的相關工作。
辦公電話:(86) 010-83979401，83979406傳真:(86)010-83560780。
電子郵件:bangongshi@bjda.gov.cn
局值班室電話:(86)010-83979400(18:00-8:00)
儀器辦公室
監督醫療器械、衛生材料、醫用生物材料和體外診斷試劑的質量、生產、經營和使用；負責醫療器械、體外診斷試劑、醫用生物材料和衛生材料的法定標準和產品分類管理的監督實施；負責醫療器械生產經營企業的審批；頒發醫用生物材料和衛生材料生產經營企業許可證；負責企業和醫療機構生產的醫療器械產品的註冊工作；負責第二類醫療器械臨床試驗的審批；負責醫療器械臨床試驗基地的初審和推薦；醫療器械產品不良反應的再評價；負責醫療器械質量體系認證和產品安全認證的實施；負責對生產、流通和使用單位的產品質量進行檢查和抽檢，發布產品質量公告；醫療器械廣告的審批。
電話:(86)010-83979525
傳真:(86)010-83560730
掛號處
負責監督實施國家和地方藥品法定標準；新藥、仿制藥、中藥保護品種和新藥臨床試驗的初審；審查藥品的出口；制定和修訂藥品、中藥飲片炮制和醫療單位制劑規範的地方標準；負責藥品的再評價和淘汰藥品的初審；依法監管麻醉藥品、精神藥品、毒性藥品、放射性藥品和特殊醫療器械。
電話:010-83979465傳真:010-83560723
電子郵件:zhucechu@bjda.gov.cn
市場辦公室
貫徹執行藥品流通法律法規，監督處方藥、非處方藥、中藥材、中藥飲片購銷規則的執行；監督藥品經營質量管理規範的實施；負責藥品批發企業的資格初審；實施藥品批發和零售企業資質制度；核發藥品零售企業許可證；監督檢查生產、經營、使用單位的藥品質量，發布全市藥品質量公報；中藥材市場的監管；藥品廣告的審批。
電話:010-83979515傳真:010-83979518。
電子郵件:shichangchu@bjda.gov.cn
安全監督辦公室
負責國家基本藥物目錄和非處方藥目錄的初審和推薦；組織實施非處方藥制度；臨床藥理學初審基地；負責組織藥品不良反應的監測；監督非臨床研究、臨床試驗、藥品生產和醫療單位執行藥品質量管理規範；為藥品生產企業和醫療單位發放制劑許可證；依法監督麻醉藥品、精神藥品、毒性藥品、戒毒藥品和放射性藥品的生產、經營和使用；核發藥包材(含容器)生產經營企業許可證。
電話:010-83979503傳真:010-83560728
電子郵件:anjianchu@bjda.gov.cn
人事處
負責機關及直屬單位幹部隊伍建設規劃的實施和調配；按照幹部管理權限負責工作人員的考核、任免、調配、獎懲、培訓、工資福利、退休等工作；指導直屬單位的人事管理工作；負責機關及直屬單位的編制和管理；負責機關及直屬單位專業技術職務的評審工作；負責實施執業藥師(含執業藥師)資格制度，組織執業藥師(含執業藥師)資格考試和註冊。
電話:010-83979481傳真:010-83560726
電子郵件:renshichu@bjda.gov.cn
監管辦公室
組織起草藥品監督管理的地方性法規草案；對本部門制定的規範性文件進行合法性審查；負責相關文件的編寫；負責行政執法監督和執法監督員的培訓；發放藥品執法人員的執法證件；調查研究有關法律、法規和規章的實施情況；承擔行政復議和行政訴訟。
電話:010-83979473傳真:010-83560725
電子郵件:faguichu@bjda.gov.cn
監督辦公室
1，監督檢查駐在部門及所屬系統貫徹黨的路線方針政策，遵守國家法律法規，執行市委市政府的決定和命令。
2.監督駐地黨組和行政領導班子及其成員維護黨的政治紀律、執行民主集中制、選拔任用領導幹部、落實黨風廉政建設和廉潔勤政責任制等情況，每半年向市紀委、市監察局報告壹次，有重大問題及時報告。
3、審定、初步核實本部門黨組和行政領導班子及其成員違反黨紀政紀的報告；參與查處本部門黨組和行政領導班子及其成員違反黨紀政紀的案件；負責查處駐在部門及其所屬部門幹部違反黨紀的案件和其他重要案件。
4.協助駐在部門黨組和行政領導班子組織協調駐在部門及所屬系統的黨風廉政建設和反腐敗工作。
5.受理對駐在部門的黨組織、黨員和行政監察對象的舉報和投訴，受理黨員和行政監察對象不服處分的投訴。
6.承辦市紀委、市監察局交辦的事項。
電話:010-83979442
電子郵件:jianchachu@bjda.gov.cn
檢查辦公室
依據藥品法律法規，負責檢查藥品研究、生產、流通和使用中的違法違規行為及其責任人；依法查處制售假劣藥品的肇事者和責任人；受理與藥品有關的違法違規案件的舉報和查處。
電話:010-83979550
電子郵件:jichachu@bjda.gov.cn
財務處
負責局機關及下屬單位的財務預算、決算管理和資金撥付；監督檢查本系統財務預算、財經紀律和各項財務管理制度的執行情況；負責本機關固定資產的管理。
電話:(86)010-83979497
驗收辦公室
負責市局行政許可事項的受理，並按照許可事項的程序規定，負責行政許可事項的統壹辦理；依照行政許可法的有關規定，決定是否受理申請人提出的許可事項；負責送達行政許可決定；行政許可事項收費；負責在辦公室公示行政許可事項。
電話:(86)010-83979426(27)
廣告部
研究制定本系統的科技發展規劃和工作計劃，並組織實施；組織協調本系統的科學研究開發、新技術推廣、科技成果評價和學術交流；負責本市藥品監督行業的宣傳工作；負責組織和指導本系統幹部的理論學習、職工的思想教育和精神文明建設。
電話:(86)010-83979435
包華辦事處
研究制定保健食品和化妝品安全工作規劃、政策和措施，並組織實施；負責保健食品和化妝品安全的監督管理，收集、匯總、分析相關信息，並定期向社會發布；負責保健食品、化妝品的監督執法，依法組織保健食品、化妝品安全事故的調查處理，組織協調保健食品、化妝品安全事故的應急救援工作；負責保健食品、化妝品產品的審查和生產經營單位的資質管理。
電話:(86)010-83979455
局黨委
宣傳貫徹黨的路線、方針、政策，宣傳貫徹黨中央、上級組織和同級組織的決議；組織黨員認真學習馬列主義、毛澤東思想、鄧小平理論和“三個代表”重要思想；學習科學文化和專業知識；嚴格管理黨員，督促黨員履行義務，確保黨員權利不受侵犯；監督黨員，嚴格執行黨的紀律，加強黨風廉政建設，堅決反對腐敗；做好國家工作人員的思想政治工作，促進社會主義精神文明和政治文明建設，了解和反映群眾意見，維護群眾合法權益，幫助群眾解決實際困難；教育、培養和考察入黨積極分子，做好發展黨員工作；協助黨組管理機關黨組織和群眾組織的幹部；配合幹部人事部門對行政幹部進行考核和民主評議；對行政幹部的任免、調動和獎勵提出意見和建議；領導機關、工會、共青團、婦聯等群眾團體，支持這些團體按照各自的章程獨立負責地開展工作；按照黨組織的隸屬關系管理和領導直屬單位的黨的工作。
電話:(86)010-83979441
電話:(010) 83979401傳真:(010) 83560780。