負責人:邱興宇
(1)協助局領導組織、協調、監督局機關政務工作。
(2)承擔局機關重要文稿和文件的起草和調研工作。
(三)負責局機關的文電處理、信息、機要保密、信訪、文件、安全保衛、財產和後勤服務工作。
(4)負責局機關行政管理和作風建設。
(五)負責組織、協調和監督衛生法制教育、衛生監督、執法、行政訴訟案件應訴、衛生行政復議和重大行政處罰案件聽證工作。
(6)負責衛生系統統計的協調和管理。
(7)完成領導交辦的其他任務。
紀檢監察室
負責人:顧小虎
(1)檢查監督局行政機關工作人員、局直屬單位黨組織和黨員執行黨的路線、方針、政策和決議，以及遵守黨內法規、黨紀和國家法律法規的情況。
(二)查處本局行政機關工作人員、系統內被監督對象、所轄黨組織和黨員幹部違反黨規黨紀和國家法律法規的案件。
(三)審查所轄單位報送黨委或上級紀委審批的案件。
(四)決定或者批準對案件中違反黨紀、政紀的人員的處分。
(五)受理違紀人員的申訴，決定批準、變更或者撤銷給予的紀律處分。
(六)受理對本局行政機關工作人員、醫療衛生單位工作人員、所轄黨組織和黨員的檢舉和控告。
(七)協助局黨委對黨員進行黨風黨紀教育，搞好黨風廉政建設和衛生道德建設。
(八)根據區政府或者上級監察機關的決定，配合本局行政機關和有關部門開展工作，對被監察部門和單位的工作進行專項檢查。
(9)完成領導交辦的其他任務。
人事科
負責人:夏風
(1)負責本系統人員流動、人才交流服務、高校畢業生就業指導、軍隊幹部招聘、轉業安置、退伍軍人安置等工作。
(2)負責系統內員工的工資、福利、考核、獎懲、退休、遺屬撫恤金的管理。
(3)負責實施衛生專業技術資格的認定和聘任，參加高校畢業生和新進人員的轉正定級工作。
(四)負責醫療衛生單位的機構設置、人員編制、定崗定編等具體工作。
(5)指導本系統內人事和分配制度改革的實施。
(6)負責本系統勞動工資的統計上報和人事檔案的管理。
(七)協助局黨委任免分管局領導幹部，區直屬醫療衛生單位黨組織建設，黨員隊伍管理，宣傳、統戰、群眾團體、知識分子和老幹部工作。
(8)完成領導交辦的其他任務。
財務審計科
負責人:金
(l)組織制定全區衛生事業發展規劃和編制衛生事業預算、決算。
(二)負責衛生事業的財務管理，進行審計監督。
(3)負責下屬單位衛生基礎設施和國有資產管理，審核基建項目，監督基建財務。
(4)負責下屬單位的價格管理，配合物價部門制定市政管理項目的收費標準，配合有關部門指導醫療衛生收費管理工作。
(5)負責系統內職工養老保險結算、房改審批和衛生事業、基礎設施、健康產業增加值統計。
(6)負責醫療衛生單位的票據管理及局財務工作。
(7)完成領導交辦的其他任務。
醫學管理系(中醫)
負責人:劉永傑
(1)研究指導醫療機構合理布局和衛生資源有效配置，負責制定並組織實施醫療機構行業管理規範。
(2)負責全區醫療信息的管理。
(三)負責醫療機構和醫療護理人員執業許可及其執業活動的監督管理，負責醫療機構采供血和血站執業活動的監督管理。
(四)加強醫療安全，依法做好醫療事件的調解處理工作，負責組織協調重大突發自然災害和事故的醫療救援。
(五)負責組織全區機關事業單位幹部保健、招錄體檢和招生體檢。
(6)負責全區醫院藥房的管理，配合有關部門做好醫院麻醉藥品、精神藥品、毒性藥品和放射性藥品的管理工作。
(七)貫徹國家中醫藥方針政策，組織制定和實施全區中醫藥發展規劃，指導全區中醫藥基本建設；組織實施中醫藥管理規範和技術標準，對中醫藥機構設備配置和中醫藥專項資金使用進行論證和審核。
(八)制定和實施本地區醫學科技、重點學科、重點人才的規劃和管理措施，組織實施醫學科技項目的申報和實施，醫學科技成果的推廣應用，監督管理醫學技術的應用和大型醫用設備的投入，負責衛生系統成人中專招生工作， 指導和協調南通市通州衛生工作者中等專業學校的管理工作，擬定在職培訓計劃，實施衛生技術人員繼續教育。
(九)制定並組織實施全區農村衛生、社區衛生服務和初級衛生保健的發展規劃和服務標準，負責全區農村初級衛生保健規劃目標的實施和評估。
(10)指導農村基層衛生組織建設和管理，負責農村社區衛生服務站業務技術建設和執業活動的監督管理。
(11)完成領導交辦的其他任務。
預防保健科
(地區血液和土壤預防辦公室)
負責人:王國慶
(1)制定全區重大傳染病和其他嚴重危害人類健康疾病的防控規劃和控制措施，並指導實施和監督檢查。
(二)貫徹各項公共衛生法規，負責全市食品、公共場所、學校、職業、放射衛生、化妝品的衛生監督管理。
(3)在發生重大疫情、自然災害等突發公共衛生事件時，組織區域衛生技術力量控制疾病的發生和蔓延。
(4)負責全區重大建設項目的預防性衛生監督，對全區醫療衛生監督和疾病控制工作進行專業指導和考核。
(5)制定全區婦幼保健工作規劃，依法開展婦幼保健工作。
(6)指導全區婦女兒童保健業務，監督婦幼保健專項技術的實施。
(七)擬定全區血吸蟲病、地方病、寄生蟲病和慢性病防治規劃，並組織實施。
(8)依法開展消毒衛生監督，指導全區健康教育工作。
(9)完成領導交辦的其他任務。
區愛國衛生運動委員會辦公室
負責人:顧冬野
(1)制定全區愛國衛生工作的長遠規劃、年度計劃和階段性實施方案。
(二)協調委員會各部門共同任務的落實。
(3)積極參與組織協調衛生城市建設、衛生村鎮創建和群眾性除四害活動。
(4)組織協調農村改水改廁工作，制定計劃，提供技術指導。
(5)開展城鄉社會衛生管理並定期檢查評估。
(6)組織群眾性衛生監督活動。
(7)制定全區健康教育規劃，協調健康教育管理工作。
(8)完成領導交辦的其他任務。