1.用工商聯絡員、數字證書或電子營業執照登錄；
2.輸入營業執照的統壹社會信用代碼或註冊號，輸入後在空白處點擊鼠標。如果自動出現企業名稱、工商聯絡員姓名、工商聯絡員手機號碼等信息，可以直接輸入已備案的聯絡員的身份號碼；
3.閱讀說明並單擊確定；
4.輸入年報信息，逐項填寫並保存基本信息、行政許可信息、網站信息、分支機構信息、資產狀況信息、社保信息，最後讀取並公示。
二、分析細節
對未按時報送年度報告、未公示相關信息、公示信息弄虛作假、通過註冊住所或經營場所無法聯系的合作社和企業，將由工商市場監管部門列入經營異常名錄，並通過全國企業信用信息公示系統向社會公示。
三。合作社的相關稅收
對農民專業合作社銷售其成員生產的農產品，視同農業生產者銷售自己生產的農產品免征增值稅；對增值稅壹般納稅人從農民專業合作社購進的免稅農產品，可按13%的抵扣率抵扣增值稅進項稅額；農民專業合作社向合作社成員銷售的農膜、種子、種苗、化肥、農藥和農業機械，免征增值稅；農民專業合作社及其成員簽訂的農產品和農業生產資料購銷合同，免征印花稅。