(壹)貫徹執行國家和自治區關於發展農牧業和農村牧區經濟工作的方針、政策、法律、法規，並監督執行；研究擬定全區種植業、畜牧業、漁業、農牧機械化、農墾、鄉鎮企業等農牧業和農村牧區經濟發展的方針、政策、發展規劃和年度計劃，並組織實施；參與制定與農牧業有關的財政、稅收、價格、金融保險、進出口等方面的政策措施。
(二)承擔完善農村牧區管理體制的責任，研究提出深化自治區農村牧區經濟體制改革和穩定、完善農村牧區基本經營制度的政策建議；組織起草自治區農牧業地方性法規草案，完善農牧業行政執法體系；支持農牧業社會化服務體系、農村牧區合作經濟組織、農牧民專業合作社和農畜產品行業協會的建設和發展；指導農村牧區土地(草原)承包、耕地使用權流轉和承包糾紛仲裁管理；監督減輕農牧民負擔和農牧民籌資籌勞管理，指導農村牧區集體資產和財務管理。
(三)負責組織實施促進糧食等主要農產品生產發展的相關政策措施，引導農業產業結構調整和產品質量提高；會同有關部門指導農業標準化和規模化生產，按照自治區規定的權限審批自治區規劃和年度計劃規模內的固定資產投資項目；編制部門預算並組織實施，提出支持農業和農村發展的財政政策和項目建議；制定農業發展規劃並監督實施；配合自治區財政廳組織實施農業綜合開發項目。
(四)負責組織實施促進畜牧業生產發展的相關政策措施，引導畜牧業產業結構調整和主要畜產品質量升級；會同有關部門指導優化畜牧業區域布局，引導標準化和規模化生產；負責乳制品生產的監督管理；負責畜牧業生產預警監測和防災減災。
(五)負責制定農牧業產業化的政策和規劃，並組織實施；指導農畜產品加工業的結構調整、技術創新和服務體系建設；研究擬定大宗農畜產品市場體系建設和發展規劃；培育、保護和發展農畜產品品牌；制定鄉鎮企業發展規則和規劃，指導縣域經濟發展；指導鄉鎮企業職業技能開發。
(六)承擔提高農畜產品質量安全水平的責任，依法開展農畜產品質量安全風險評估，發布農畜產品質量安全狀況信息，負責農畜產品質量安全監測；負責審查農牧業轉基因生物生產加工許可；會同有關部門組織實施農畜產品質量安全國家評價標準，指導農畜檢驗檢測體系建設，依法實施符合安全標準的農畜產品認證和監督管理。
(七)組織協調農業生產資料市場體系建設，依法實施農作物種子(種苗)、草種、畜禽、農藥、獸藥、飼料、飼料添加劑的生產、銷售許可和監督管理；依法負責漁船、漁具、網具的監督管理；負責獸用醫療器械及相關肥料的監督管理；組織飼料資源的保護和合理開發利用，負責飼料產品質量安全管理；負責農業機械產品質量的監督管理。
(八)負責農作物病蟲害和畜禽疫病的防治，起草動植物防疫檢疫法規，會同有關部門制定動植物防疫檢疫措施，並組織實施；負責指導動植物防疫檢疫體系建設，組織監督全區動植物防疫檢疫工作，發布疫情和組織撲滅工作；負責組織植物檢疫性有害生物普查；負責獸醫學、獸醫學和生物安全，負責執業獸醫的管理。
(九)承擔農牧業防災減災責任，負責農牧業災情監測和發布，組織儲備和調撥種子、化肥等救災物資；對生產救災資金的安排和使用提出建議，指導搶險救災和災後生產恢復。
(十)負責管理農牧業和農村牧區經濟信息工作，負責農牧業信息系統建設；監測和分析農牧業和農村牧區經濟運行情況，開展農牧業和農村牧區統計，發布農牧業和農村牧區經濟信息，指導農業信息服務。
(十壹)負責制定自治區農牧業科學研究和農牧業技術推廣的規劃、計劃和相關政策，會同有關部門組織農牧業科技創新體系和農牧業產業技術體系建設；根據分工組織實施農牧業重大專項科學研究，組織實施農牧業領域高新技術和應用技術研究，轉化推廣農牧業科技成果，負責農牧業科技成果管理；組織引進國外農牧業先進技術，開展農牧業貿易促進及相關的經濟技術交流與合作；指導農業技術推廣體系改革和建設，負責農牧業新品種保護和農牧業轉基因生物安全監督管理。
(十二)組織和指導農牧業教育和農牧業職業技能開發，參與實施農村牧區實用人才培訓工程，承擔農村牧區勞動力轉移就業培訓；配合有關部門依法實施農村牧區人才專業技術資格相關管理工作。
(十三)指導農牧業用地、漁業水域、草原、宜農宜牧灘塗、宜農宜牧濕地的保護和管理，負責水生野生動物的保護；制定耕地和基本農田質量保護措施並指導實施，依法管理耕地質量；利用工程設施、農學、農機、生物學發展節水農業；會同有關部門處理重大漁業糾紛，維護漁業水域的漁業權益，代表自治區人民政府行使漁船檢驗和漁政漁港監督管理權。
(十四)負責實施農牧業生態建設規劃、草原生態保護和建設規劃，指導草原保護、建設和合理利用，指導農村牧區可再生能源綜合開發利用；指導農牧業生物質產業發展、農牧業和農村牧區節能減排，承擔農牧業水汙染治理相關工作；指導發展生態農牧業和循環農牧業，負責保護漁業水域生態環境。
(十五)承辦自治區人民政府交辦的其他工作。