長期以來，菲律賓深受販毒集團的侵害，即在菲律賓首都馬尼拉，有92%以上的地區存在中度毒品犯罪，社會秩序混亂，各種治安刑事案件頻發。針對這種情況，杜特爾特采取了“鐵腕”手段，堅決打擊毒品犯罪。
杜特爾特曾說要把毒販的屍體扔進馬尼拉灣餵魚。他曾表示，只要逮捕或擊斃壹名毒梟，就能獲得300萬比索的獎勵，獎金由杜特爾特剩余的競選資金支付。但值得註意的是，民眾對這壹行動持反對意見，甚至上街遊行，因為許多警察打著打擊販毒的幌子，隨意開槍打死好人，包括許多未成年兒童。這壹事件再次引起西方關註，指責杜特爾特侵犯人權。但是，藥物中毒的效果是顯著的。相當壹部分人到警察局自首，但也有壹部分人害怕被警察無辜槍斃，幹脆承認自己是毒販，在監獄裏避難。
但面對嚴峻的禁毒形勢，杜特爾特認為，如果任其發展，對菲律賓來說並不是壹件好事。西方的這些指責是惡意的。杜特爾特的總統任期極其危險。不久前，杜特爾特在菲律賓閱兵時差點被炸彈炸死，參加閱兵的士兵也嚇得亂作壹團，非常混亂。我不知道菲律賓真的發生了國難。