牡丹江市教育局是牡丹江市人民政府主管教育的職能部門。貫徹黨和國家的教育方針和有關法律法規，指導和監督各地、各學校貫徹執行；指導和協調縣(市)區和市直部門的相關教育工作。
負責全市各級各類教育的布局規劃、結構調整和資源配置；制定全市教育發展規劃和年度發展計劃，指導和協調具體實施，提出教育發展重點、規模、速度和步驟。
統籌管理全市學前教育、基礎教育、職業教育、成人教育、民辦教育、特殊教育、地方高等院校等教育工作；負責高等院校教育、農墾和森工的協調工作。
積極推進素質教育，組織和指導全市各類學校的思想政治工作、德育工作、教育教學工作、後勤工作、體育衛生藝術教育和國防教育；規劃、指導和推動教育系統的科學研究和教育科研成果的推廣。
負責全市中小學幼兒園的安全穩定工作；協調和指導教育系統重大突發公共事件和重大安全事故的處理；負責全市校園食品衛生的檢查和指導；協調公安部門對校警、安保人員和安全教育培訓的管理；指導教育系統社會治安綜合治理工作。
貫徹國家語言文字工作的方針政策，制定語言文字工作的長遠規劃，協調、監督、檢查全市語言文字工作。管理全市教育系統的對外交流與國際合作。市級以下人民政府教育行政部門負責教育督導工作。完成市委、市政府交辦的其他工作。