加工貿易稅款繳納保函是指加工企業在加工貿易業務中向海關或有關部門提供的保證在規定期限內繳納相關稅款的擔保文件。其目的是確保加工企業在完成加工貿易業務後，能夠按照國家規定按時足額繳納相關稅款，從而維護國家稅收安全和穩定。
壹、保函的出具和提交
加工企業在開展加工貿易業務前，需要向海關或相關部門申請出具加工貿易稅收擔保。保函的出具應符合海關或相關部門的規定，並載明擔保金額、期限、方式等關鍵信息。保函出具後，加工企業應按要求向海關或有關部門報送備案。
二、保函的保證責任
加工貿易納稅擔保的擔保責任主要包括兩個方面:壹是保證加工企業在規定期限內完成加工貿易業務並繳納相關稅款；二是加工企業未按時足額納稅的，擔保人承擔相應的擔保責任，即代為納稅或承擔其他約定責任。
第三，保函的取消和終止
加工貿易納稅擔保在擔保期內有效。加工企業按期完成加工貿易業務並繳納相關稅款的，保函自動解除。加工企業未按時納稅的，只有在擔保人履行了擔保責任後，才能終止擔保。同時，如發生其他約定的取消或終止，保函也將相應取消或終止。
第四，保函的風險防範
擔保人在為加工貿易納稅提供擔保時，應充分調查和評估加工企業的信用狀況和經營狀況，確保擔保風險可控。同時，加工企業也需要加強內部管理，規範加工貿易業務流程，確保稅款及時足額繳納，規避安全風險。
總而言之:
加工貿易納稅擔保書是加工企業在開展加工貿易業務時向海關或有關部門提供的壹種擔保文件，旨在保證加工企業能夠按時足額繳納相關稅款。在發放、提交、擔保責任、撤銷和終止等方面，加工企業和擔保人必須遵守相關規定，加強風險防範，確保加工貿易業務的順利開展和稅收安全的維護。
法律依據:
中華人民共和國海關法
第55條規定:
進出口貨物的收發貨人和進出口貨物的所有人是關稅的納稅義務人。納稅人應當在海關規定的期限內繳納稅款；逾期不繳納的，除依法追繳外，由海關處以應納稅額1倍以上5倍以下的罰款；納稅義務人或者擔保人超過3個月未繳納稅款的，經直屬海關關長或者其授權的下屬海關關長批準，海關可以采取下列強制措施:
(壹)書面通知其開戶銀行或者其他金融機構從其存款中扣繳稅款；
(二)依法銷售應稅貨物，以銷售所得抵繳稅款；
(三)扣押、變賣價值相當於依法應納稅款的貨物或者其他財產，以變賣所得抵繳稅款。
中華人民共和國證券法
第6條規定:
本法所稱保證，是指保證人與債權人約定，在債務人不履行債務時，保證人按照約定履行債務或者承擔責任的行為。