1.根據施工圖預算編制竣工結算。增減項目和費用的調整預算應在業主或業主委托的監理工程師審批簽證後編制。
2、包幹合同結算方式準備竣工結算。這種方法實際上是以施工圖預算為基礎的竣工結算加上系數包幹。根據合同，尚若不存在超出包幹範圍的工程增減，包幹費用為最終結算費用。
3.根據房屋建築成本編制竣工結算。這樣，雙方根據施工圖紙和有關技術經濟資料，計算確定每平方米造價，再按實際完成的平方米數進行結算。
4.根據投標費用編制竣工結算。如果項目是邀請招標的，承包商可以在報價中采用合理的浮動。通常情況下，中標人根據工期、質量、獎懲、雙方承擔的責任簽訂工程合同，實行壹次性包幹工程造價。合同規定的費用為竣工結算費用。結算時只需將合同雙方約定的獎罰費用和超出包幹範圍的工程增減，作為“合同補充說明”進入工程竣工結算。
工程竣工決算審計的特點:
1，政策強。基本建設具有投資大、周期長的特點。為了加強建設資金的管理，使有限的資金發揮最大的效益，國家制定了許多關於建設資金管理和使用的制度和規定。這些法律法規的正確實施和運用，是管好用好建設資金的保證，也是審計人員審計決算的重要依據。如計劃的完成情況、資金的合理來源、定額的應用、施工企業的合理收費等。，應根據國家相關法律法規進行檢查和監督。
2.高科技。工程竣工決算審計不僅要有壹定的基建財務知識，還要熟悉和熟練閱讀工程圖紙和計算工程量。定額的應用，各種取費標準的計算，施工程序和施工經驗的掌握。這些工程技術知識的正確掌握和運用將直接影響決算審計的質量。
3.覆蓋面廣。工程竣工決算審計不僅涉及資金來源、使用、交換、結算等資金運動的全過程，還涉及材料供應、圖紙變更、國家政策調整、價格波動等各個方面。審計人員在工作中必須實事求是，客觀公正地對待上述環節的各個方面。
法律依據:
基本建設項目竣工決算管理暫行辦法
第六條編制項目竣工財務決算的依據主要包括:國家相關法律法規；經批準的可行性研究報告、初步設計、概算和概算調整文件；招標文件和投標文件、施工合同、代理施工、勘察設計、監理和設備采購、政府采購批準文件和采購合同；歷年下達的項目年度財政投資計劃和預算；工程結算資料；相關會計和財務管理信息；其他相關信息。