1.當事人申請鑒定時，應當在舉證期限內提出申請。申請鑒定時，應當預交鑒定費，並提供相關材料；
2.當事人的鑒定申請經法院批準後，由雙方協商確定具有鑒定資格的鑒定機構和鑒定人。協商不成的，由人民法院指定；
3.當事人對人民法院委托的鑒定部門作出的鑒定結論有異議，申請重新鑒定，提供證據證明有下列情形之壹的，人民法院應予準許:
(1)評估機構或評估師不具備相關評估資質；
(二)鑒定程序嚴重違法的；
(三)鑒定結論明顯不足的；
(四)其他經質證不能作為證據的情形；
4.瑕疵鑒定結論可以通過補充鑒定、重新鑒定或者補充質證解決的，不再重新鑒定。
法院處理案件的程序如下:
1.訴訟階段，準備訴訟所需的相關材料，撰寫訴訟文書，以書面形式如實表述故事；
2.在受理階段，法院會對索賠進行核查。符合受理標準的，法院將按照法律規定的程序決定立案；
3.在審前準備階段，法院會向被告發出傳票，期間可以互相出示相關證據，雙方可以進行調解；
4.開庭期間，法院正式受理此案，對此事進行調查，雙方辯論，商議直至最終宣判。
綜上所述，申請司法鑒定需要向有關部門提交相關證據材料。對相關機構的鑒定結果有異議的，可以申請重新鑒定。
法律依據:
《司法鑒定程序通則》第十二條
委托人委托鑒定的，應當向司法鑒定機構提供真實、完整、充分的鑒定材料，並對鑒定材料的真實性、合法性負責。司法鑒定機構應當核對並記錄鑒定材料的名稱、種類、數量、特性、保存狀況和接收時間。
當事人對鑒定材料有異議的，應當向委托人提出。
本通則所稱鑒定材料包括生物樣品和非生物樣品、對照樣品材料以及與鑒定事項有關的其他鑒定材料。