1，辦公室
制定本局和本系統的年度工作計劃和長遠發展規劃；處理局機關日常事務，起草和審核相關文件和報告；負責綜合會議組織、文秘事務、文電處理、文件檔案、文印、信訪、保密、調研、政務信息、稅務宣傳和外事工作；負責組織稅收科研、學術交流和科研成果的鑒定、評選、推廣和獎勵；制定辦公室規章制度；管理機關財務、機關行政事務等後勤保障工作；負責局機關和系統目標管理的考核和監督工作；組織實施綜合行政管理信息系統；辦理NPC代表和CPPCC委員的建議；協助領導綜合協調相關工作。
2.稅務管理科
負責流轉稅、所得稅等稅種的稅務管理業務；管理增值稅專用發票；負責金稅工程流轉稅業務的管理、推廣應用、認證和稅務備案、數據采集和審計管理；負責增值稅等稅種的納稅評估、日常審計和日常管理檢查；負責稅收協定執行、反避稅、外國居民稅收監管、信息交流、國際稅收管理合作等工作。；負責涉稅法律事務；負責組織稅收法律法規實施的日常管理監督檢查；承辦重大稅收案件的審理、行政處罰和聽證；負責稅務行政訴訟和行政復議；負責審核確認出口企業退(免)稅申報，組織實施地方出口貨物征稅，回復外商來信，檢查指導地方出口貨物專用繳款書和聯單的開具。
3.收藏管理科
負責組織實施綜合性稅收征管法律、法規和規章，處理稅收征管法律、法規實施中的有關事項；負責稅務登記、納稅申報、稅收征管和稅收信息的管理；牽頭組織對征管質量的全面評估；負責組織征管軟件的推廣應用；牽頭組織、實施、指導、協調和管理納稅評估工作；負責納稅服務的組織和管理。
4.人事教育組
研究和實施人事管理制度；負責組織、編制、任免、考核、調配、交流、辭職辭退、工資福利、專業技術職務等人事管理工作；負責離退休幹部的管理和服務；負責思想政治工作、精神文明建設和基層建設；負責教育和培訓的管理；負責黨建、工會、* *共青團、婦聯工作。
5.監督辦公室
負責監督檢查黨和國家的路線、方針和稅收法規的執行情況；負責黨的紀律檢查、行政監察和廉政建設；負責執法監督和整改工作；負責信訪舉報，查處違法違紀案件。
6.規劃和統計科
負責稅收計劃管理、稅收核算、統計等信息數據的統計和分析；負責稅收計劃的編制和分配，指導組織收入工作，進行稅收預測分析，負責稅收征管信息的集中處理和核算，組織檢查稅收征管、匯算清繳制度的執行情況；負責稅源數據的調查和計算，監控重點稅源；負責稅務憑證的管理。
7.稅務服務辦公室
辦稅服務廳主要負責納稅人在稅務機關辦理的各類涉稅事項，包括稅務登記、納稅申報、稅款征收、稅款繳納、欠稅公告、發票購銷、稅法宣傳、金稅發售、納稅申報審核、咨詢輔導、受理減免稅申請及相關優惠政策等。
8.稅源管理科
負責轄區內涉外企業納稅人的分類管理和服務；全面掌握稅收信息，分析稅源變化，進行稅收預測和稅收監控；負責稅收政策法規的宣傳；負責稅務檢查和催繳；負責執行涉外所得稅法律法規和國際稅收協定；負責外商投資企業和外國企業的所得稅業務；負責外商投資企業和外國企業的稅收征管和反避稅工作；負責組織涉外稅收日常管理檢查，參與涉外稅收執法檢查；負責涉外企業的免稅和退稅；負責組織涉外企業的稅務審計；監控關鍵稅源。
9.稅源管理二科
負責轄區內納稅人納稅評估管理，以及行業、企業集團和關聯企業之間的納稅評估；做好重點避稅嫌疑人的稅務稽查工作，處理違規行為；組織企業審計和納稅評估，監控重點稅源。
10，僅楚稅務分局
負責轄區內納稅人的稅收管理。具體負責所轄納稅人稅務登記和納稅申報的調查核實、納稅預測分析、納稅宣傳、納稅輔導、稅務調查、納稅服務、日常檢查、戶籍管理、政策送達、稅源調查、定額核定、催繳、數據采集分析、納稅評估的組織實施、壹般違法行為處理和零星稅收征收等工作。
11，石灰窯稅務分局
負責石灰窯辦事處、黃武辦事處和臥龍工業園區納稅人的稅務管理。
旗山稅務分局12
負責西南河路以西、環山路以南、大海陽路以東(岐山辦事處、毓皇頂辦事處)的稅收管理工作。
東山稅務分局13
負責西南河路以東、環山路以北(東山辦事處；179北街、虹口路、和平巷、南山路、芙蓉街、向陽辦事處)，調查核實納稅人稅務登記、納稅申報情況，開展稅收預測分析、稅收宣傳、納稅輔導、納稅調研、納稅服務、日常檢查、戶籍管理、政策送達、稅源調查、定額核定、催辦、數據收集分析、組織。
14，通深稅務分局
負責前進路以北、青年路以西(芝罘屯、環海路、膠東市場、青年路13號、建設路7、9號、16、17號、富17號、前進路6、7、9號)範圍內的稅收管理。具體職責是:稅務登記管理、發票管理、納稅評估、稅源監控、催繳以及政策法規和管理檢查；
15，黃武稅務局
負責大海洋路以西(不含通深分局、三水大廈、白石、翡翠路轄區)稅收管理。
16，信息中心
負責組織稅務管理、綜合行政管理等信息系統建設；實施信息系統管理制度和技術標準；建立、管理和維護計算機網絡和稅務信息的綜合數據庫；參與組織應用軟件開發和稅控儀器的推廣、應用及技術培訓；根據工作需要，對采集和管理的數據進行質量審核、處理和綜合分析；負責網絡和系統安全管理。